Protein–RNA interactions for Protein: O60315

ZEB2, Zinc finger E-box-binding homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZEB2O60315 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ZEB2O60315 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ZEB2O60315 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
ZEB2O60315 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ZEB2O60315 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ZEB2O60315 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ZEB2O60315 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ZEB2O60315 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ZEB2O60315 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ZEB2O60315 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ZEB2O60315 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ZEB2O60315 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ZEB2O60315 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ZEB2O60315 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ZEB2O60315 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
ZEB2O60315 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ZEB2O60315 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ZEB2O60315 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ZEB2O60315 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
ZEB2O60315 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ZEB2O60315 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ZEB2O60315 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ZEB2O60315 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ZEB2O60315 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ZEB2O60315 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
ZEB2O60315 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ZEB2O60315 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ZEB2O60315 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ZEB2O60315 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ZEB2O60315 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ZEB2O60315 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ZEB2O60315 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ZEB2O60315 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ZEB2O60315 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
ZEB2O60315 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
ZEB2O60315 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
ZEB2O60315 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
ZEB2O60315 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ZEB2O60315 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ZEB2O60315 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ZEB2O60315 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ZEB2O60315 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
ZEB2O60315 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ZEB2O60315 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ZEB2O60315 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ZEB2O60315 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ZEB2O60315 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ZEB2O60315 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ZEB2O60315 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ZEB2O60315 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ZEB2O60315 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
ZEB2O60315 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ZEB2O60315 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
ZEB2O60315 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ZEB2O60315 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ZEB2O60315 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ZEB2O60315 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
ZEB2O60315 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ZEB2O60315 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
ZEB2O60315 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC27.89■■■□□ 2.06
ZEB2O60315 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
ZEB2O60315 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
ZEB2O60315 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
ZEB2O60315 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ZEB2O60315 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
ZEB2O60315 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
ZEB2O60315 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ZEB2O60315 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ZEB2O60315 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ZEB2O60315 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ZEB2O60315 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ZEB2O60315 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ZEB2O60315 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ZEB2O60315 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ZEB2O60315 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ZEB2O60315 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ZEB2O60315 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ZEB2O60315 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ZEB2O60315 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ZEB2O60315 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ZEB2O60315 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ZEB2O60315 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
ZEB2O60315 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
ZEB2O60315 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.04
ZEB2O60315 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ZEB2O60315 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ZEB2O60315 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ZEB2O60315 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
ZEB2O60315 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ZEB2O60315 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ZEB2O60315 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ZEB2O60315 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ZEB2O60315 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ZEB2O60315 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ZEB2O60315 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ZEB2O60315 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ZEB2O60315 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ZEB2O60315 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ZEB2O60315 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ZEB2O60315 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 148 ms