Protein–RNA interactions for Protein: O60264

SMARCA5, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A member 5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA5O60264 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
SMARCA5O60264 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
SMARCA5O60264 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
SMARCA5O60264 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
SMARCA5O60264 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
SMARCA5O60264 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.68■■■□□ 2.5
SMARCA5O60264 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC30.67■■■□□ 2.5
SMARCA5O60264 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
SMARCA5O60264 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC30.66■■■□□ 2.5
SMARCA5O60264 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
SMARCA5O60264 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
SMARCA5O60264 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
SMARCA5O60264 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
SMARCA5O60264 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
SMARCA5O60264 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
SMARCA5O60264 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.49
SMARCA5O60264 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
SMARCA5O60264 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
SMARCA5O60264 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
SMARCA5O60264 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
SMARCA5O60264 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
SMARCA5O60264 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC30.63■■■□□ 2.49
SMARCA5O60264 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
SMARCA5O60264 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
SMARCA5O60264 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
SMARCA5O60264 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
SMARCA5O60264 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
SMARCA5O60264 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
SMARCA5O60264 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
SMARCA5O60264 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC30.61■■■□□ 2.49
SMARCA5O60264 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
SMARCA5O60264 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
SMARCA5O60264 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
SMARCA5O60264 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC30.6■■■□□ 2.49
SMARCA5O60264 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
SMARCA5O60264 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
SMARCA5O60264 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
SMARCA5O60264 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
SMARCA5O60264 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
SMARCA5O60264 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
SMARCA5O60264 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
SMARCA5O60264 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
SMARCA5O60264 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
SMARCA5O60264 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
SMARCA5O60264 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
SMARCA5O60264 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
SMARCA5O60264 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC30.56■■■□□ 2.48
SMARCA5O60264 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
SMARCA5O60264 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
SMARCA5O60264 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
SMARCA5O60264 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
SMARCA5O60264 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
SMARCA5O60264 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
SMARCA5O60264 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
SMARCA5O60264 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
SMARCA5O60264 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
SMARCA5O60264 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
SMARCA5O60264 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
SMARCA5O60264 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
SMARCA5O60264 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
SMARCA5O60264 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
SMARCA5O60264 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
SMARCA5O60264 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
SMARCA5O60264 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
SMARCA5O60264 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
SMARCA5O60264 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
SMARCA5O60264 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC30.52■■■□□ 2.48
SMARCA5O60264 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
SMARCA5O60264 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
SMARCA5O60264 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
SMARCA5O60264 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
SMARCA5O60264 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC30.51■■■□□ 2.47
SMARCA5O60264 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
SMARCA5O60264 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
SMARCA5O60264 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
SMARCA5O60264 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
SMARCA5O60264 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
SMARCA5O60264 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
SMARCA5O60264 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
SMARCA5O60264 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.49■■■□□ 2.47
SMARCA5O60264 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
SMARCA5O60264 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
SMARCA5O60264 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
SMARCA5O60264 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
SMARCA5O60264 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC30.48■■■□□ 2.47
SMARCA5O60264 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
SMARCA5O60264 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
SMARCA5O60264 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
SMARCA5O60264 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
SMARCA5O60264 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
SMARCA5O60264 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
SMARCA5O60264 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
SMARCA5O60264 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
SMARCA5O60264 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
SMARCA5O60264 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
SMARCA5O60264 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.47
SMARCA5O60264 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
SMARCA5O60264 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
SMARCA5O60264 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC30.45■■■□□ 2.47
SMARCA5O60264 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms