Protein–RNA interactions for Protein: O43257

ZNHIT1, Zinc finger HIT domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNHIT1O43257 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNHIT1O43257 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNHIT1O43257 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNHIT1O43257 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNHIT1O43257 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNHIT1O43257 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNHIT1O43257 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNHIT1O43257 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNHIT1O43257 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNHIT1O43257 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNHIT1O43257 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNHIT1O43257 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNHIT1O43257 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNHIT1O43257 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNHIT1O43257 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNHIT1O43257 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNHIT1O43257 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNHIT1O43257 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNHIT1O43257 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNHIT1O43257 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNHIT1O43257 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNHIT1O43257 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ZNHIT1O43257 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNHIT1O43257 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNHIT1O43257 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNHIT1O43257 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNHIT1O43257 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNHIT1O43257 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNHIT1O43257 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNHIT1O43257 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNHIT1O43257 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNHIT1O43257 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNHIT1O43257 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNHIT1O43257 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNHIT1O43257 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNHIT1O43257 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNHIT1O43257 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNHIT1O43257 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNHIT1O43257 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNHIT1O43257 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNHIT1O43257 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNHIT1O43257 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNHIT1O43257 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNHIT1O43257 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNHIT1O43257 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNHIT1O43257 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNHIT1O43257 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNHIT1O43257 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNHIT1O43257 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNHIT1O43257 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZNHIT1O43257 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZNHIT1O43257 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZNHIT1O43257 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
ZNHIT1O43257 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ZNHIT1O43257 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ZNHIT1O43257 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNHIT1O43257 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNHIT1O43257 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNHIT1O43257 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNHIT1O43257 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNHIT1O43257 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNHIT1O43257 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNHIT1O43257 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNHIT1O43257 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNHIT1O43257 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNHIT1O43257 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNHIT1O43257 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNHIT1O43257 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNHIT1O43257 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNHIT1O43257 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNHIT1O43257 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNHIT1O43257 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNHIT1O43257 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNHIT1O43257 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNHIT1O43257 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNHIT1O43257 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNHIT1O43257 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNHIT1O43257 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNHIT1O43257 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNHIT1O43257 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNHIT1O43257 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNHIT1O43257 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNHIT1O43257 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNHIT1O43257 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNHIT1O43257 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNHIT1O43257 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNHIT1O43257 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNHIT1O43257 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNHIT1O43257 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNHIT1O43257 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNHIT1O43257 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNHIT1O43257 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNHIT1O43257 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNHIT1O43257 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNHIT1O43257 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNHIT1O43257 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNHIT1O43257 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNHIT1O43257 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNHIT1O43257 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNHIT1O43257 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms