Protein–RNA interactions for Protein: O43181

NDUFS4, NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 4, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFS4O43181 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NDUFS4O43181 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NDUFS4O43181 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NDUFS4O43181 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NDUFS4O43181 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NDUFS4O43181 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NDUFS4O43181 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
NDUFS4O43181 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NDUFS4O43181 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NDUFS4O43181 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NDUFS4O43181 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NDUFS4O43181 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NDUFS4O43181 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NDUFS4O43181 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NDUFS4O43181 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NDUFS4O43181 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NDUFS4O43181 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NDUFS4O43181 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NDUFS4O43181 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NDUFS4O43181 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NDUFS4O43181 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
NDUFS4O43181 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NDUFS4O43181 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NDUFS4O43181 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NDUFS4O43181 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
NDUFS4O43181 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
NDUFS4O43181 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NDUFS4O43181 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NDUFS4O43181 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NDUFS4O43181 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NDUFS4O43181 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NDUFS4O43181 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NDUFS4O43181 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
NDUFS4O43181 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NDUFS4O43181 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NDUFS4O43181 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NDUFS4O43181 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NDUFS4O43181 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NDUFS4O43181 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NDUFS4O43181 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NDUFS4O43181 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NDUFS4O43181 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NDUFS4O43181 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NDUFS4O43181 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NDUFS4O43181 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NDUFS4O43181 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NDUFS4O43181 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NDUFS4O43181 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NDUFS4O43181 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NDUFS4O43181 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NDUFS4O43181 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NDUFS4O43181 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NDUFS4O43181 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NDUFS4O43181 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NDUFS4O43181 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NDUFS4O43181 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NDUFS4O43181 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NDUFS4O43181 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NDUFS4O43181 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NDUFS4O43181 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NDUFS4O43181 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NDUFS4O43181 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NDUFS4O43181 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NDUFS4O43181 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
NDUFS4O43181 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NDUFS4O43181 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NDUFS4O43181 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NDUFS4O43181 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NDUFS4O43181 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NDUFS4O43181 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NDUFS4O43181 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NDUFS4O43181 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NDUFS4O43181 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
NDUFS4O43181 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NDUFS4O43181 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
NDUFS4O43181 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NDUFS4O43181 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NDUFS4O43181 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NDUFS4O43181 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NDUFS4O43181 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NDUFS4O43181 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
NDUFS4O43181 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NDUFS4O43181 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NDUFS4O43181 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NDUFS4O43181 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NDUFS4O43181 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NDUFS4O43181 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NDUFS4O43181 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NDUFS4O43181 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NDUFS4O43181 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NDUFS4O43181 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NDUFS4O43181 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
NDUFS4O43181 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NDUFS4O43181 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NDUFS4O43181 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
NDUFS4O43181 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NDUFS4O43181 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NDUFS4O43181 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NDUFS4O43181 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NDUFS4O43181 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
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