Protein–RNA interactions for Protein: O14936

CASK, Peripheral plasma membrane protein CASK, humanhuman

Predictions only

Length 926 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASKO14936 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CASKO14936 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CASKO14936 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
CASKO14936 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CASKO14936 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CASKO14936 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CASKO14936 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CASKO14936 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CASKO14936 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CASKO14936 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CASKO14936 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CASKO14936 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CASKO14936 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CASKO14936 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CASKO14936 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CASKO14936 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CASKO14936 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CASKO14936 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CASKO14936 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CASKO14936 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CASKO14936 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CASKO14936 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CASKO14936 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CASKO14936 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CASKO14936 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CASKO14936 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CASKO14936 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CASKO14936 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CASKO14936 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CASKO14936 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CASKO14936 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CASKO14936 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CASKO14936 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CASKO14936 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CASKO14936 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CASKO14936 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CASKO14936 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CASKO14936 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CASKO14936 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CASKO14936 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CASKO14936 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CASKO14936 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CASKO14936 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CASKO14936 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CASKO14936 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CASKO14936 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CASKO14936 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CASKO14936 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CASKO14936 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CASKO14936 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CASKO14936 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CASKO14936 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CASKO14936 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CASKO14936 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CASKO14936 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CASKO14936 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CASKO14936 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CASKO14936 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CASKO14936 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CASKO14936 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CASKO14936 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CASKO14936 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CASKO14936 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CASKO14936 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CASKO14936 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CASKO14936 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CASKO14936 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CASKO14936 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CASKO14936 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CASKO14936 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CASKO14936 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CASKO14936 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CASKO14936 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CASKO14936 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CASKO14936 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CASKO14936 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CASKO14936 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CASKO14936 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CASKO14936 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CASKO14936 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CASKO14936 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
CASKO14936 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CASKO14936 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CASKO14936 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CASKO14936 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CASKO14936 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CASKO14936 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CASKO14936 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CASKO14936 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CASKO14936 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CASKO14936 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CASKO14936 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CASKO14936 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CASKO14936 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CASKO14936 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CASKO14936 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CASKO14936 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CASKO14936 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CASKO14936 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CASKO14936 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms