Protein–RNA interactions for Protein: O14828

SCAMP3, Secretory carrier-associated membrane protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP3O14828 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SCAMP3O14828 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SCAMP3O14828 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SCAMP3O14828 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SCAMP3O14828 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SCAMP3O14828 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
SCAMP3O14828 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SCAMP3O14828 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SCAMP3O14828 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
SCAMP3O14828 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SCAMP3O14828 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SCAMP3O14828 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SCAMP3O14828 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SCAMP3O14828 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SCAMP3O14828 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SCAMP3O14828 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SCAMP3O14828 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SCAMP3O14828 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SCAMP3O14828 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SCAMP3O14828 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SCAMP3O14828 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SCAMP3O14828 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SCAMP3O14828 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SCAMP3O14828 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
SCAMP3O14828 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
SCAMP3O14828 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SCAMP3O14828 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SCAMP3O14828 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SCAMP3O14828 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SCAMP3O14828 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
SCAMP3O14828 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SCAMP3O14828 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
SCAMP3O14828 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SCAMP3O14828 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SCAMP3O14828 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SCAMP3O14828 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SCAMP3O14828 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SCAMP3O14828 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
SCAMP3O14828 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SCAMP3O14828 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SCAMP3O14828 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SCAMP3O14828 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SCAMP3O14828 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SCAMP3O14828 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
SCAMP3O14828 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SCAMP3O14828 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SCAMP3O14828 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SCAMP3O14828 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SCAMP3O14828 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
SCAMP3O14828 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SCAMP3O14828 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SCAMP3O14828 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SCAMP3O14828 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SCAMP3O14828 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
SCAMP3O14828 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SCAMP3O14828 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SCAMP3O14828 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SCAMP3O14828 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
SCAMP3O14828 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SCAMP3O14828 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SCAMP3O14828 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
SCAMP3O14828 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SCAMP3O14828 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SCAMP3O14828 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SCAMP3O14828 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
SCAMP3O14828 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
SCAMP3O14828 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SCAMP3O14828 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
SCAMP3O14828 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SCAMP3O14828 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SCAMP3O14828 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
SCAMP3O14828 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SCAMP3O14828 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SCAMP3O14828 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SCAMP3O14828 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SCAMP3O14828 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SCAMP3O14828 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SCAMP3O14828 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SCAMP3O14828 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
SCAMP3O14828 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
SCAMP3O14828 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SCAMP3O14828 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SCAMP3O14828 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SCAMP3O14828 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SCAMP3O14828 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SCAMP3O14828 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SCAMP3O14828 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SCAMP3O14828 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
SCAMP3O14828 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SCAMP3O14828 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SCAMP3O14828 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SCAMP3O14828 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SCAMP3O14828 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SCAMP3O14828 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SCAMP3O14828 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SCAMP3O14828 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SCAMP3O14828 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SCAMP3O14828 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SCAMP3O14828 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SCAMP3O14828 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms