Protein–RNA interactions for Protein: O14544

SOCS6, Suppressor of cytokine signaling 6, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOCS6O14544 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SOCS6O14544 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SOCS6O14544 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SOCS6O14544 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SOCS6O14544 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SOCS6O14544 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SOCS6O14544 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SOCS6O14544 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SOCS6O14544 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SOCS6O14544 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SOCS6O14544 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SOCS6O14544 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SOCS6O14544 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SOCS6O14544 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SOCS6O14544 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SOCS6O14544 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SOCS6O14544 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SOCS6O14544 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SOCS6O14544 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SOCS6O14544 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SOCS6O14544 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SOCS6O14544 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SOCS6O14544 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SOCS6O14544 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SOCS6O14544 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SOCS6O14544 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SOCS6O14544 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SOCS6O14544 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SOCS6O14544 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SOCS6O14544 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SOCS6O14544 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SOCS6O14544 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SOCS6O14544 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SOCS6O14544 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SOCS6O14544 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SOCS6O14544 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SOCS6O14544 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SOCS6O14544 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SOCS6O14544 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SOCS6O14544 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SOCS6O14544 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SOCS6O14544 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SOCS6O14544 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SOCS6O14544 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SOCS6O14544 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SOCS6O14544 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SOCS6O14544 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SOCS6O14544 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SOCS6O14544 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SOCS6O14544 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SOCS6O14544 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SOCS6O14544 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SOCS6O14544 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SOCS6O14544 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SOCS6O14544 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SOCS6O14544 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SOCS6O14544 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SOCS6O14544 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SOCS6O14544 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SOCS6O14544 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SOCS6O14544 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SOCS6O14544 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SOCS6O14544 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SOCS6O14544 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SOCS6O14544 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SOCS6O14544 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SOCS6O14544 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SOCS6O14544 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SOCS6O14544 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SOCS6O14544 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SOCS6O14544 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SOCS6O14544 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SOCS6O14544 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SOCS6O14544 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SOCS6O14544 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SOCS6O14544 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SOCS6O14544 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SOCS6O14544 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SOCS6O14544 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SOCS6O14544 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SOCS6O14544 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SOCS6O14544 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SOCS6O14544 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SOCS6O14544 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SOCS6O14544 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SOCS6O14544 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SOCS6O14544 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SOCS6O14544 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SOCS6O14544 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SOCS6O14544 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SOCS6O14544 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SOCS6O14544 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SOCS6O14544 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SOCS6O14544 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SOCS6O14544 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SOCS6O14544 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SOCS6O14544 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SOCS6O14544 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SOCS6O14544 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SOCS6O14544 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.3 ms