Protein–RNA interactions for Protein: F8VP50

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F8VP50 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
F8VP50 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
F8VP50 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
F8VP50 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
F8VP50 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
F8VP50 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
F8VP50 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
F8VP50 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
F8VP50 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
F8VP50 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
F8VP50 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
F8VP50 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
F8VP50 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
F8VP50 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
F8VP50 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
F8VP50 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
F8VP50 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
F8VP50 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
F8VP50 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
F8VP50 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
F8VP50 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
F8VP50 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
F8VP50 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
F8VP50 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
F8VP50 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
F8VP50 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
F8VP50 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
F8VP50 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
F8VP50 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
F8VP50 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
F8VP50 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
F8VP50 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
F8VP50 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
F8VP50 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
F8VP50 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
F8VP50 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
F8VP50 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
F8VP50 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
F8VP50 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
F8VP50 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
F8VP50 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
F8VP50 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
F8VP50 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
F8VP50 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
F8VP50 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
F8VP50 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
F8VP50 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
F8VP50 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
F8VP50 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
F8VP50 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
F8VP50 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
F8VP50 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
F8VP50 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
F8VP50 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
F8VP50 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
F8VP50 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
F8VP50 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
F8VP50 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
F8VP50 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
F8VP50 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
F8VP50 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
F8VP50 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
F8VP50 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
F8VP50 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
F8VP50 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
F8VP50 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
F8VP50 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
F8VP50 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
F8VP50 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
F8VP50 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
F8VP50 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
F8VP50 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
F8VP50 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
F8VP50 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
F8VP50 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
F8VP50 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
F8VP50 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
F8VP50 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
F8VP50 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
F8VP50 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
F8VP50 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
F8VP50 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
F8VP50 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
F8VP50 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
F8VP50 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
F8VP50 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
F8VP50 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
F8VP50 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
F8VP50 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
F8VP50 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
F8VP50 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
F8VP50 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
F8VP50 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
F8VP50 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
F8VP50 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
F8VP50 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
F8VP50 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
F8VP50 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
F8VP50 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
F8VP50 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms