Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

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Length 477 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
ERVV-1B6SEH8 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
ERVV-1B6SEH8 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC31.46■■■□□ 2.63
ERVV-1B6SEH8 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
ERVV-1B6SEH8 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
ERVV-1B6SEH8 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
ERVV-1B6SEH8 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
ERVV-1B6SEH8 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC31.45■■■□□ 2.63
ERVV-1B6SEH8 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
ERVV-1B6SEH8 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
ERVV-1B6SEH8 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC31.45■■■□□ 2.63
ERVV-1B6SEH8 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
ERVV-1B6SEH8 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
ERVV-1B6SEH8 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
ERVV-1B6SEH8 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
ERVV-1B6SEH8 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC31.43■■■□□ 2.62
ERVV-1B6SEH8 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
ERVV-1B6SEH8 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
ERVV-1B6SEH8 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.62
ERVV-1B6SEH8 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC31.42■■■□□ 2.62
ERVV-1B6SEH8 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC31.41■■■□□ 2.62
ERVV-1B6SEH8 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC31.4■■■□□ 2.62
ERVV-1B6SEH8 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.4■■■□□ 2.62
ERVV-1B6SEH8 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC31.4■■■□□ 2.62
ERVV-1B6SEH8 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC31.4■■■□□ 2.62
ERVV-1B6SEH8 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC31.4■■■□□ 2.62
ERVV-1B6SEH8 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
ERVV-1B6SEH8 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC31.39■■■□□ 2.62
ERVV-1B6SEH8 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
ERVV-1B6SEH8 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.39■■■□□ 2.62
ERVV-1B6SEH8 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
ERVV-1B6SEH8 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC31.38■■■□□ 2.61
ERVV-1B6SEH8 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
ERVV-1B6SEH8 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
ERVV-1B6SEH8 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.36■■■□□ 2.61
ERVV-1B6SEH8 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC31.36■■■□□ 2.61
ERVV-1B6SEH8 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
ERVV-1B6SEH8 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
ERVV-1B6SEH8 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
ERVV-1B6SEH8 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC31.35■■■□□ 2.61
ERVV-1B6SEH8 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
ERVV-1B6SEH8 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC31.35■■■□□ 2.61
ERVV-1B6SEH8 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.35■■■□□ 2.61
ERVV-1B6SEH8 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
ERVV-1B6SEH8 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC31.34■■■□□ 2.61
ERVV-1B6SEH8 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC31.34■■■□□ 2.61
ERVV-1B6SEH8 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC31.33■■■□□ 2.61
ERVV-1B6SEH8 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
ERVV-1B6SEH8 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
ERVV-1B6SEH8 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.32■■■□□ 2.61
ERVV-1B6SEH8 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
ERVV-1B6SEH8 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.32■■■□□ 2.6
ERVV-1B6SEH8 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
ERVV-1B6SEH8 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC31.32■■■□□ 2.6
ERVV-1B6SEH8 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
ERVV-1B6SEH8 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC31.32■■■□□ 2.6
ERVV-1B6SEH8 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
ERVV-1B6SEH8 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
ERVV-1B6SEH8 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC31.31■■■□□ 2.6
ERVV-1B6SEH8 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC31.31■■■□□ 2.6
ERVV-1B6SEH8 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC31.31■■■□□ 2.6
ERVV-1B6SEH8 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC31.31■■■□□ 2.6
ERVV-1B6SEH8 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC31.31■■■□□ 2.6
ERVV-1B6SEH8 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC31.31■■■□□ 2.6
ERVV-1B6SEH8 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
ERVV-1B6SEH8 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
ERVV-1B6SEH8 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
ERVV-1B6SEH8 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
ERVV-1B6SEH8 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC31.29■■■□□ 2.6
ERVV-1B6SEH8 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC31.29■■■□□ 2.6
ERVV-1B6SEH8 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC31.29■■■□□ 2.6
ERVV-1B6SEH8 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
ERVV-1B6SEH8 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
ERVV-1B6SEH8 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
ERVV-1B6SEH8 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
ERVV-1B6SEH8 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.28■■■□□ 2.6
ERVV-1B6SEH8 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC31.28■■■□□ 2.6
ERVV-1B6SEH8 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
ERVV-1B6SEH8 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC31.27■■■□□ 2.6
ERVV-1B6SEH8 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
ERVV-1B6SEH8 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC31.26■■■□□ 2.59
ERVV-1B6SEH8 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.59
ERVV-1B6SEH8 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
ERVV-1B6SEH8 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
ERVV-1B6SEH8 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
ERVV-1B6SEH8 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
ERVV-1B6SEH8 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
ERVV-1B6SEH8 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
ERVV-1B6SEH8 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
ERVV-1B6SEH8 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC31.23■■■□□ 2.59
ERVV-1B6SEH8 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC31.23■■■□□ 2.59
ERVV-1B6SEH8 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC31.23■■■□□ 2.59
ERVV-1B6SEH8 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
ERVV-1B6SEH8 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.23■■■□□ 2.59
ERVV-1B6SEH8 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
ERVV-1B6SEH8 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
ERVV-1B6SEH8 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
ERVV-1B6SEH8 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
ERVV-1B6SEH8 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
ERVV-1B6SEH8 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
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