Protein–RNA interactions for Protein: A8MQ03

CYSRT1, Cysteine-rich tail protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYSRT1A8MQ03 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CYSRT1A8MQ03 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CYSRT1A8MQ03 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CYSRT1A8MQ03 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CYSRT1A8MQ03 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CYSRT1A8MQ03 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CYSRT1A8MQ03 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CYSRT1A8MQ03 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CYSRT1A8MQ03 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CYSRT1A8MQ03 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CYSRT1A8MQ03 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CYSRT1A8MQ03 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CYSRT1A8MQ03 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CYSRT1A8MQ03 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CYSRT1A8MQ03 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CYSRT1A8MQ03 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CYSRT1A8MQ03 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CYSRT1A8MQ03 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CYSRT1A8MQ03 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CYSRT1A8MQ03 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CYSRT1A8MQ03 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CYSRT1A8MQ03 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CYSRT1A8MQ03 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CYSRT1A8MQ03 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CYSRT1A8MQ03 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CYSRT1A8MQ03 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CYSRT1A8MQ03 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CYSRT1A8MQ03 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CYSRT1A8MQ03 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CYSRT1A8MQ03 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CYSRT1A8MQ03 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CYSRT1A8MQ03 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CYSRT1A8MQ03 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CYSRT1A8MQ03 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CYSRT1A8MQ03 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CYSRT1A8MQ03 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CYSRT1A8MQ03 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CYSRT1A8MQ03 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CYSRT1A8MQ03 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CYSRT1A8MQ03 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CYSRT1A8MQ03 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CYSRT1A8MQ03 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CYSRT1A8MQ03 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CYSRT1A8MQ03 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CYSRT1A8MQ03 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CYSRT1A8MQ03 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CYSRT1A8MQ03 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CYSRT1A8MQ03 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CYSRT1A8MQ03 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CYSRT1A8MQ03 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CYSRT1A8MQ03 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CYSRT1A8MQ03 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CYSRT1A8MQ03 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CYSRT1A8MQ03 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CYSRT1A8MQ03 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CYSRT1A8MQ03 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CYSRT1A8MQ03 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CYSRT1A8MQ03 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CYSRT1A8MQ03 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CYSRT1A8MQ03 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CYSRT1A8MQ03 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CYSRT1A8MQ03 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CYSRT1A8MQ03 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CYSRT1A8MQ03 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CYSRT1A8MQ03 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CYSRT1A8MQ03 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CYSRT1A8MQ03 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CYSRT1A8MQ03 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CYSRT1A8MQ03 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CYSRT1A8MQ03 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CYSRT1A8MQ03 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CYSRT1A8MQ03 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CYSRT1A8MQ03 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CYSRT1A8MQ03 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CYSRT1A8MQ03 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CYSRT1A8MQ03 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CYSRT1A8MQ03 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CYSRT1A8MQ03 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CYSRT1A8MQ03 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CYSRT1A8MQ03 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CYSRT1A8MQ03 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CYSRT1A8MQ03 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CYSRT1A8MQ03 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CYSRT1A8MQ03 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CYSRT1A8MQ03 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CYSRT1A8MQ03 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CYSRT1A8MQ03 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CYSRT1A8MQ03 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CYSRT1A8MQ03 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CYSRT1A8MQ03 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CYSRT1A8MQ03 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CYSRT1A8MQ03 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CYSRT1A8MQ03 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CYSRT1A8MQ03 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CYSRT1A8MQ03 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CYSRT1A8MQ03 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CYSRT1A8MQ03 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CYSRT1A8MQ03 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CYSRT1A8MQ03 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CYSRT1A8MQ03 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms