Protein–RNA interactions for Protein: A0A1B0GVQ0

SPAAR, Small regulatory polypeptide of amino acid response, humanhuman

Predictions only

Length 90 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPAARA0A1B0GVQ0 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SPAARA0A1B0GVQ0 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SPAARA0A1B0GVQ0 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SPAARA0A1B0GVQ0 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SPAARA0A1B0GVQ0 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SPAARA0A1B0GVQ0 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SPAARA0A1B0GVQ0 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SPAARA0A1B0GVQ0 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SPAARA0A1B0GVQ0 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SPAARA0A1B0GVQ0 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SPAARA0A1B0GVQ0 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SPAARA0A1B0GVQ0 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SPAARA0A1B0GVQ0 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SPAARA0A1B0GVQ0 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SPAARA0A1B0GVQ0 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SPAARA0A1B0GVQ0 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SPAARA0A1B0GVQ0 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SPAARA0A1B0GVQ0 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SPAARA0A1B0GVQ0 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SPAARA0A1B0GVQ0 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPAARA0A1B0GVQ0 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPAARA0A1B0GVQ0 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPAARA0A1B0GVQ0 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPAARA0A1B0GVQ0 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPAARA0A1B0GVQ0 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPAARA0A1B0GVQ0 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPAARA0A1B0GVQ0 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPAARA0A1B0GVQ0 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPAARA0A1B0GVQ0 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SPAARA0A1B0GVQ0 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SPAARA0A1B0GVQ0 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SPAARA0A1B0GVQ0 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SPAARA0A1B0GVQ0 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SPAARA0A1B0GVQ0 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SPAARA0A1B0GVQ0 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SPAARA0A1B0GVQ0 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SPAARA0A1B0GVQ0 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SPAARA0A1B0GVQ0 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SPAARA0A1B0GVQ0 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SPAARA0A1B0GVQ0 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SPAARA0A1B0GVQ0 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SPAARA0A1B0GVQ0 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SPAARA0A1B0GVQ0 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SPAARA0A1B0GVQ0 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SPAARA0A1B0GVQ0 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SPAARA0A1B0GVQ0 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SPAARA0A1B0GVQ0 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SPAARA0A1B0GVQ0 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SPAARA0A1B0GVQ0 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SPAARA0A1B0GVQ0 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SPAARA0A1B0GVQ0 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SPAARA0A1B0GVQ0 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SPAARA0A1B0GVQ0 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SPAARA0A1B0GVQ0 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SPAARA0A1B0GVQ0 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SPAARA0A1B0GVQ0 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SPAARA0A1B0GVQ0 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SPAARA0A1B0GVQ0 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SPAARA0A1B0GVQ0 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SPAARA0A1B0GVQ0 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SPAARA0A1B0GVQ0 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SPAARA0A1B0GVQ0 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SPAARA0A1B0GVQ0 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SPAARA0A1B0GVQ0 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SPAARA0A1B0GVQ0 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SPAARA0A1B0GVQ0 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SPAARA0A1B0GVQ0 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SPAARA0A1B0GVQ0 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SPAARA0A1B0GVQ0 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SPAARA0A1B0GVQ0 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SPAARA0A1B0GVQ0 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SPAARA0A1B0GVQ0 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SPAARA0A1B0GVQ0 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SPAARA0A1B0GVQ0 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SPAARA0A1B0GVQ0 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SPAARA0A1B0GVQ0 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SPAARA0A1B0GVQ0 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SPAARA0A1B0GVQ0 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SPAARA0A1B0GVQ0 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SPAARA0A1B0GVQ0 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SPAARA0A1B0GVQ0 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SPAARA0A1B0GVQ0 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SPAARA0A1B0GVQ0 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.43
SPAARA0A1B0GVQ0 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SPAARA0A1B0GVQ0 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SPAARA0A1B0GVQ0 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SPAARA0A1B0GVQ0 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SPAARA0A1B0GVQ0 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SPAARA0A1B0GVQ0 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SPAARA0A1B0GVQ0 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SPAARA0A1B0GVQ0 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SPAARA0A1B0GVQ0 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SPAARA0A1B0GVQ0 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SPAARA0A1B0GVQ0 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SPAARA0A1B0GVQ0 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SPAARA0A1B0GVQ0 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SPAARA0A1B0GVQ0 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SPAARA0A1B0GVQ0 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SPAARA0A1B0GVQ0 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SPAARA0A1B0GVQ0 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms