Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WWV3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 80 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A087WWV3 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
A0A087WWV3 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
A0A087WWV3 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
A0A087WWV3 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
A0A087WWV3 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
A0A087WWV3 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
A0A087WWV3 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
A0A087WWV3 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
A0A087WWV3 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
A0A087WWV3 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
A0A087WWV3 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
A0A087WWV3 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
A0A087WWV3 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
A0A087WWV3 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
A0A087WWV3 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
A0A087WWV3 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
A0A087WWV3 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
A0A087WWV3 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
A0A087WWV3 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
A0A087WWV3 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
A0A087WWV3 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
A0A087WWV3 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
A0A087WWV3 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
A0A087WWV3 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
A0A087WWV3 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
A0A087WWV3 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
A0A087WWV3 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
A0A087WWV3 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
A0A087WWV3 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
A0A087WWV3 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.14■■■□□ 2.1
A0A087WWV3 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
A0A087WWV3 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
A0A087WWV3 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC28.14■■■□□ 2.09
A0A087WWV3 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
A0A087WWV3 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
A0A087WWV3 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
A0A087WWV3 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
A0A087WWV3 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
A0A087WWV3 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
A0A087WWV3 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
A0A087WWV3 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
A0A087WWV3 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
A0A087WWV3 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
A0A087WWV3 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
A0A087WWV3 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
A0A087WWV3 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
A0A087WWV3 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
A0A087WWV3 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
A0A087WWV3 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
A0A087WWV3 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
A0A087WWV3 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
A0A087WWV3 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
A0A087WWV3 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
A0A087WWV3 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
A0A087WWV3 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
A0A087WWV3 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
A0A087WWV3 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
A0A087WWV3 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
A0A087WWV3 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
A0A087WWV3 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
A0A087WWV3 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
A0A087WWV3 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
A0A087WWV3 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
A0A087WWV3 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
A0A087WWV3 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
A0A087WWV3 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
A0A087WWV3 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
A0A087WWV3 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
A0A087WWV3 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
A0A087WWV3 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
A0A087WWV3 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
A0A087WWV3 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
A0A087WWV3 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
A0A087WWV3 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
A0A087WWV3 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
A0A087WWV3 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
A0A087WWV3 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
A0A087WWV3 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
A0A087WWV3 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
A0A087WWV3 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
A0A087WWV3 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
A0A087WWV3 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
A0A087WWV3 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
A0A087WWV3 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
A0A087WWV3 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
A0A087WWV3 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
A0A087WWV3 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
A0A087WWV3 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
A0A087WWV3 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
A0A087WWV3 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
A0A087WWV3 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
A0A087WWV3 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
A0A087WWV3 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
A0A087WWV3 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
A0A087WWV3 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
A0A087WWV3 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
A0A087WWV3 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
A0A087WWV3 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
A0A087WWV3 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
A0A087WWV3 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
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