Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6C7

LINC00312, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00312, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00312Q9Y6C7 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
LINC00312Q9Y6C7 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
LINC00312Q9Y6C7 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
LINC00312Q9Y6C7 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
LINC00312Q9Y6C7 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
LINC00312Q9Y6C7 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
LINC00312Q9Y6C7 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
LINC00312Q9Y6C7 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
LINC00312Q9Y6C7 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
LINC00312Q9Y6C7 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
LINC00312Q9Y6C7 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
LINC00312Q9Y6C7 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
LINC00312Q9Y6C7 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
LINC00312Q9Y6C7 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
LINC00312Q9Y6C7 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
LINC00312Q9Y6C7 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
LINC00312Q9Y6C7 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC14.96□□□□□ -0.01
LINC00312Q9Y6C7 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC14.96□□□□□ -0.01
LINC00312Q9Y6C7 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
LINC00312Q9Y6C7 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
LINC00312Q9Y6C7 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
LINC00312Q9Y6C7 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
LINC00312Q9Y6C7 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
LINC00312Q9Y6C7 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
LINC00312Q9Y6C7 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
LINC00312Q9Y6C7 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
LINC00312Q9Y6C7 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
LINC00312Q9Y6C7 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.02
LINC00312Q9Y6C7 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
LINC00312Q9Y6C7 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
LINC00312Q9Y6C7 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
LINC00312Q9Y6C7 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
LINC00312Q9Y6C7 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
LINC00312Q9Y6C7 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
LINC00312Q9Y6C7 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
LINC00312Q9Y6C7 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
LINC00312Q9Y6C7 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
LINC00312Q9Y6C7 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
LINC00312Q9Y6C7 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
LINC00312Q9Y6C7 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LINC00312Q9Y6C7 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LINC00312Q9Y6C7 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LINC00312Q9Y6C7 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LINC00312Q9Y6C7 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LINC00312Q9Y6C7 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LINC00312Q9Y6C7 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LINC00312Q9Y6C7 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LINC00312Q9Y6C7 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LINC00312Q9Y6C7 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LINC00312Q9Y6C7 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LINC00312Q9Y6C7 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LINC00312Q9Y6C7 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LINC00312Q9Y6C7 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LINC00312Q9Y6C7 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LINC00312Q9Y6C7 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LINC00312Q9Y6C7 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LINC00312Q9Y6C7 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LINC00312Q9Y6C7 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LINC00312Q9Y6C7 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LINC00312Q9Y6C7 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LINC00312Q9Y6C7 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LINC00312Q9Y6C7 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LINC00312Q9Y6C7 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LINC00312Q9Y6C7 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LINC00312Q9Y6C7 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
LINC00312Q9Y6C7 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LINC00312Q9Y6C7 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LINC00312Q9Y6C7 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LINC00312Q9Y6C7 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LINC00312Q9Y6C7 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LINC00312Q9Y6C7 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LINC00312Q9Y6C7 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LINC00312Q9Y6C7 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LINC00312Q9Y6C7 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LINC00312Q9Y6C7 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LINC00312Q9Y6C7 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LINC00312Q9Y6C7 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LINC00312Q9Y6C7 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
LINC00312Q9Y6C7 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LINC00312Q9Y6C7 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
LINC00312Q9Y6C7 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LINC00312Q9Y6C7 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
LINC00312Q9Y6C7 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LINC00312Q9Y6C7 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LINC00312Q9Y6C7 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LINC00312Q9Y6C7 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
LINC00312Q9Y6C7 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
LINC00312Q9Y6C7 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LINC00312Q9Y6C7 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LINC00312Q9Y6C7 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LINC00312Q9Y6C7 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LINC00312Q9Y6C7 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LINC00312Q9Y6C7 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LINC00312Q9Y6C7 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LINC00312Q9Y6C7 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LINC00312Q9Y6C7 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LINC00312Q9Y6C7 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LINC00312Q9Y6C7 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LINC00312Q9Y6C7 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LINC00312Q9Y6C7 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms