Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y446

PKP3, Plakophilin-3, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP3Q9Y446 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PKP3Q9Y446 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PKP3Q9Y446 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PKP3Q9Y446 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PKP3Q9Y446 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PKP3Q9Y446 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PKP3Q9Y446 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PKP3Q9Y446 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PKP3Q9Y446 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PKP3Q9Y446 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PKP3Q9Y446 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PKP3Q9Y446 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PKP3Q9Y446 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PKP3Q9Y446 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PKP3Q9Y446 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PKP3Q9Y446 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PKP3Q9Y446 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PKP3Q9Y446 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PKP3Q9Y446 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PKP3Q9Y446 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PKP3Q9Y446 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PKP3Q9Y446 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PKP3Q9Y446 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PKP3Q9Y446 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PKP3Q9Y446 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PKP3Q9Y446 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PKP3Q9Y446 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PKP3Q9Y446 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PKP3Q9Y446 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PKP3Q9Y446 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PKP3Q9Y446 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PKP3Q9Y446 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PKP3Q9Y446 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PKP3Q9Y446 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PKP3Q9Y446 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PKP3Q9Y446 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PKP3Q9Y446 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PKP3Q9Y446 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PKP3Q9Y446 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PKP3Q9Y446 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PKP3Q9Y446 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PKP3Q9Y446 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PKP3Q9Y446 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PKP3Q9Y446 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PKP3Q9Y446 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PKP3Q9Y446 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PKP3Q9Y446 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PKP3Q9Y446 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PKP3Q9Y446 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PKP3Q9Y446 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PKP3Q9Y446 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PKP3Q9Y446 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PKP3Q9Y446 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PKP3Q9Y446 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PKP3Q9Y446 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PKP3Q9Y446 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PKP3Q9Y446 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PKP3Q9Y446 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PKP3Q9Y446 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PKP3Q9Y446 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PKP3Q9Y446 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PKP3Q9Y446 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PKP3Q9Y446 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PKP3Q9Y446 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PKP3Q9Y446 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PKP3Q9Y446 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PKP3Q9Y446 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PKP3Q9Y446 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PKP3Q9Y446 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PKP3Q9Y446 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PKP3Q9Y446 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PKP3Q9Y446 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PKP3Q9Y446 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PKP3Q9Y446 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PKP3Q9Y446 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PKP3Q9Y446 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PKP3Q9Y446 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PKP3Q9Y446 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PKP3Q9Y446 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PKP3Q9Y446 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PKP3Q9Y446 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PKP3Q9Y446 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PKP3Q9Y446 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PKP3Q9Y446 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PKP3Q9Y446 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PKP3Q9Y446 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PKP3Q9Y446 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PKP3Q9Y446 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PKP3Q9Y446 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PKP3Q9Y446 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PKP3Q9Y446 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PKP3Q9Y446 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PKP3Q9Y446 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PKP3Q9Y446 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PKP3Q9Y446 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PKP3Q9Y446 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PKP3Q9Y446 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PKP3Q9Y446 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PKP3Q9Y446 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PKP3Q9Y446 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms