Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3F1

Putative TAP2-associated 6.5 kDa polypeptide, humanhuman

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Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9Y3F1 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Q9Y3F1 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Q9Y3F1 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Q9Y3F1 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Q9Y3F1 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Q9Y3F1 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Q9Y3F1 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Q9Y3F1 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Q9Y3F1 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Q9Y3F1 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Q9Y3F1 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Q9Y3F1 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Q9Y3F1 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Q9Y3F1 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Q9Y3F1 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Q9Y3F1 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Q9Y3F1 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Q9Y3F1 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Q9Y3F1 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Q9Y3F1 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Q9Y3F1 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Q9Y3F1 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Q9Y3F1 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Q9Y3F1 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Q9Y3F1 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Q9Y3F1 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Q9Y3F1 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Q9Y3F1 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Q9Y3F1 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Q9Y3F1 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Q9Y3F1 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Q9Y3F1 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Q9Y3F1 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Q9Y3F1 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Q9Y3F1 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Q9Y3F1 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Q9Y3F1 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Q9Y3F1 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Q9Y3F1 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Q9Y3F1 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Q9Y3F1 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Q9Y3F1 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Q9Y3F1 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Q9Y3F1 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Q9Y3F1 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Q9Y3F1 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Q9Y3F1 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Q9Y3F1 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Q9Y3F1 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Q9Y3F1 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Q9Y3F1 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Q9Y3F1 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Q9Y3F1 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Q9Y3F1 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Q9Y3F1 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Q9Y3F1 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Q9Y3F1 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Q9Y3F1 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Q9Y3F1 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Q9Y3F1 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Q9Y3F1 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Q9Y3F1 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Q9Y3F1 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Q9Y3F1 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Q9Y3F1 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Q9Y3F1 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Q9Y3F1 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Q9Y3F1 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Q9Y3F1 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Q9Y3F1 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Q9Y3F1 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Q9Y3F1 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Q9Y3F1 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Q9Y3F1 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Q9Y3F1 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Q9Y3F1 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Q9Y3F1 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Q9Y3F1 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Q9Y3F1 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Q9Y3F1 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Q9Y3F1 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Q9Y3F1 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Q9Y3F1 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Q9Y3F1 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Q9Y3F1 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Q9Y3F1 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Q9Y3F1 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Q9Y3F1 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Q9Y3F1 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Q9Y3F1 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Q9Y3F1 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Q9Y3F1 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Q9Y3F1 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Q9Y3F1 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Q9Y3F1 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Q9Y3F1 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Q9Y3F1 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Q9Y3F1 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Q9Y3F1 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Q9Y3F1 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
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