Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2K6

USP20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 20, humanhuman

Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP20Q9Y2K6 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
USP20Q9Y2K6 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
USP20Q9Y2K6 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC19.87■□□□□ 0.77
USP20Q9Y2K6 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
USP20Q9Y2K6 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
USP20Q9Y2K6 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
USP20Q9Y2K6 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
USP20Q9Y2K6 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
USP20Q9Y2K6 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
USP20Q9Y2K6 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
USP20Q9Y2K6 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
USP20Q9Y2K6 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
USP20Q9Y2K6 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
USP20Q9Y2K6 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
USP20Q9Y2K6 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
USP20Q9Y2K6 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
USP20Q9Y2K6 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
USP20Q9Y2K6 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
USP20Q9Y2K6 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
USP20Q9Y2K6 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
USP20Q9Y2K6 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
USP20Q9Y2K6 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
USP20Q9Y2K6 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
USP20Q9Y2K6 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
USP20Q9Y2K6 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
USP20Q9Y2K6 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
USP20Q9Y2K6 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
USP20Q9Y2K6 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
USP20Q9Y2K6 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
USP20Q9Y2K6 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
USP20Q9Y2K6 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
USP20Q9Y2K6 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
USP20Q9Y2K6 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
USP20Q9Y2K6 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
USP20Q9Y2K6 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.85■□□□□ 0.77
USP20Q9Y2K6 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
USP20Q9Y2K6 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
USP20Q9Y2K6 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
USP20Q9Y2K6 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
USP20Q9Y2K6 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
USP20Q9Y2K6 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
USP20Q9Y2K6 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
USP20Q9Y2K6 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
USP20Q9Y2K6 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
USP20Q9Y2K6 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
USP20Q9Y2K6 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
USP20Q9Y2K6 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
USP20Q9Y2K6 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
USP20Q9Y2K6 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
USP20Q9Y2K6 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
USP20Q9Y2K6 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
USP20Q9Y2K6 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
USP20Q9Y2K6 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
USP20Q9Y2K6 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
USP20Q9Y2K6 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
USP20Q9Y2K6 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
USP20Q9Y2K6 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
USP20Q9Y2K6 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
USP20Q9Y2K6 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
USP20Q9Y2K6 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
USP20Q9Y2K6 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
USP20Q9Y2K6 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
USP20Q9Y2K6 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
USP20Q9Y2K6 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
USP20Q9Y2K6 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
USP20Q9Y2K6 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
USP20Q9Y2K6 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
USP20Q9Y2K6 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
USP20Q9Y2K6 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
USP20Q9Y2K6 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
USP20Q9Y2K6 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
USP20Q9Y2K6 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
USP20Q9Y2K6 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
USP20Q9Y2K6 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
USP20Q9Y2K6 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
USP20Q9Y2K6 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
USP20Q9Y2K6 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
USP20Q9Y2K6 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
USP20Q9Y2K6 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
USP20Q9Y2K6 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
USP20Q9Y2K6 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
USP20Q9Y2K6 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
USP20Q9Y2K6 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
USP20Q9Y2K6 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
USP20Q9Y2K6 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
USP20Q9Y2K6 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
USP20Q9Y2K6 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
USP20Q9Y2K6 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
USP20Q9Y2K6 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
USP20Q9Y2K6 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
USP20Q9Y2K6 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
USP20Q9Y2K6 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
USP20Q9Y2K6 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
USP20Q9Y2K6 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
USP20Q9Y2K6 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
USP20Q9Y2K6 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
USP20Q9Y2K6 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
USP20Q9Y2K6 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
USP20Q9Y2K6 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
USP20Q9Y2K6 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms