Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y244

POMP, Proteasome maturation protein, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POMPQ9Y244 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
POMPQ9Y244 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
POMPQ9Y244 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
POMPQ9Y244 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
POMPQ9Y244 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
POMPQ9Y244 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
POMPQ9Y244 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
POMPQ9Y244 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
POMPQ9Y244 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
POMPQ9Y244 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
POMPQ9Y244 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
POMPQ9Y244 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
POMPQ9Y244 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
POMPQ9Y244 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
POMPQ9Y244 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
POMPQ9Y244 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
POMPQ9Y244 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
POMPQ9Y244 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
POMPQ9Y244 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
POMPQ9Y244 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
POMPQ9Y244 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
POMPQ9Y244 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
POMPQ9Y244 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
POMPQ9Y244 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
POMPQ9Y244 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
POMPQ9Y244 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
POMPQ9Y244 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
POMPQ9Y244 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
POMPQ9Y244 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
POMPQ9Y244 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
POMPQ9Y244 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
POMPQ9Y244 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
POMPQ9Y244 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
POMPQ9Y244 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
POMPQ9Y244 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
POMPQ9Y244 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
POMPQ9Y244 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
POMPQ9Y244 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
POMPQ9Y244 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
POMPQ9Y244 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
POMPQ9Y244 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
POMPQ9Y244 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
POMPQ9Y244 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
POMPQ9Y244 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
POMPQ9Y244 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
POMPQ9Y244 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
POMPQ9Y244 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
POMPQ9Y244 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
POMPQ9Y244 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
POMPQ9Y244 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
POMPQ9Y244 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
POMPQ9Y244 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
POMPQ9Y244 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
POMPQ9Y244 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
POMPQ9Y244 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
POMPQ9Y244 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
POMPQ9Y244 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
POMPQ9Y244 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
POMPQ9Y244 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
POMPQ9Y244 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
POMPQ9Y244 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
POMPQ9Y244 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
POMPQ9Y244 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
POMPQ9Y244 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
POMPQ9Y244 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
POMPQ9Y244 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
POMPQ9Y244 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
POMPQ9Y244 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
POMPQ9Y244 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
POMPQ9Y244 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
POMPQ9Y244 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
POMPQ9Y244 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
POMPQ9Y244 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
POMPQ9Y244 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
POMPQ9Y244 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
POMPQ9Y244 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
POMPQ9Y244 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
POMPQ9Y244 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
POMPQ9Y244 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
POMPQ9Y244 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
POMPQ9Y244 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
POMPQ9Y244 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
POMPQ9Y244 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
POMPQ9Y244 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
POMPQ9Y244 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
POMPQ9Y244 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
POMPQ9Y244 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
POMPQ9Y244 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
POMPQ9Y244 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
POMPQ9Y244 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
POMPQ9Y244 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
POMPQ9Y244 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
POMPQ9Y244 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
POMPQ9Y244 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
POMPQ9Y244 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
POMPQ9Y244 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
POMPQ9Y244 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
POMPQ9Y244 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
POMPQ9Y244 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
POMPQ9Y244 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms