Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX0

IGSF9B, Protein turtle homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 1,349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF9BQ9UPX0 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
IGSF9BQ9UPX0 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
IGSF9BQ9UPX0 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
IGSF9BQ9UPX0 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
IGSF9BQ9UPX0 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
IGSF9BQ9UPX0 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
IGSF9BQ9UPX0 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
IGSF9BQ9UPX0 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
IGSF9BQ9UPX0 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
IGSF9BQ9UPX0 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
IGSF9BQ9UPX0 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
IGSF9BQ9UPX0 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
IGSF9BQ9UPX0 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
IGSF9BQ9UPX0 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
IGSF9BQ9UPX0 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
IGSF9BQ9UPX0 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
IGSF9BQ9UPX0 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
IGSF9BQ9UPX0 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
IGSF9BQ9UPX0 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
IGSF9BQ9UPX0 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
IGSF9BQ9UPX0 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
IGSF9BQ9UPX0 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
IGSF9BQ9UPX0 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
IGSF9BQ9UPX0 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
IGSF9BQ9UPX0 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
IGSF9BQ9UPX0 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
IGSF9BQ9UPX0 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
IGSF9BQ9UPX0 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
IGSF9BQ9UPX0 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
IGSF9BQ9UPX0 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
IGSF9BQ9UPX0 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
IGSF9BQ9UPX0 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
IGSF9BQ9UPX0 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
IGSF9BQ9UPX0 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
IGSF9BQ9UPX0 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
IGSF9BQ9UPX0 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
IGSF9BQ9UPX0 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
IGSF9BQ9UPX0 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
IGSF9BQ9UPX0 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
IGSF9BQ9UPX0 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
IGSF9BQ9UPX0 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
IGSF9BQ9UPX0 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
IGSF9BQ9UPX0 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
IGSF9BQ9UPX0 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
IGSF9BQ9UPX0 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
IGSF9BQ9UPX0 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
IGSF9BQ9UPX0 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
IGSF9BQ9UPX0 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
IGSF9BQ9UPX0 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
IGSF9BQ9UPX0 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
IGSF9BQ9UPX0 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
IGSF9BQ9UPX0 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
IGSF9BQ9UPX0 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
IGSF9BQ9UPX0 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
IGSF9BQ9UPX0 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
IGSF9BQ9UPX0 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
IGSF9BQ9UPX0 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
IGSF9BQ9UPX0 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
IGSF9BQ9UPX0 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
IGSF9BQ9UPX0 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
IGSF9BQ9UPX0 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
IGSF9BQ9UPX0 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
IGSF9BQ9UPX0 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
IGSF9BQ9UPX0 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
IGSF9BQ9UPX0 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
IGSF9BQ9UPX0 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
IGSF9BQ9UPX0 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
IGSF9BQ9UPX0 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
IGSF9BQ9UPX0 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
IGSF9BQ9UPX0 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
IGSF9BQ9UPX0 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
IGSF9BQ9UPX0 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
IGSF9BQ9UPX0 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
IGSF9BQ9UPX0 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
IGSF9BQ9UPX0 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
IGSF9BQ9UPX0 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
IGSF9BQ9UPX0 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
IGSF9BQ9UPX0 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
IGSF9BQ9UPX0 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
IGSF9BQ9UPX0 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
IGSF9BQ9UPX0 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
IGSF9BQ9UPX0 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
IGSF9BQ9UPX0 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
IGSF9BQ9UPX0 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
IGSF9BQ9UPX0 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
IGSF9BQ9UPX0 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
IGSF9BQ9UPX0 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
IGSF9BQ9UPX0 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
IGSF9BQ9UPX0 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
IGSF9BQ9UPX0 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
IGSF9BQ9UPX0 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
IGSF9BQ9UPX0 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
IGSF9BQ9UPX0 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
IGSF9BQ9UPX0 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
IGSF9BQ9UPX0 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
IGSF9BQ9UPX0 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
IGSF9BQ9UPX0 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
IGSF9BQ9UPX0 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
IGSF9BQ9UPX0 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
IGSF9BQ9UPX0 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms