Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ4

TRIM35, Tripartite motif-containing protein 35, humanhuman

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Length 493 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM35Q9UPQ4 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRIM35Q9UPQ4 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRIM35Q9UPQ4 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRIM35Q9UPQ4 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRIM35Q9UPQ4 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRIM35Q9UPQ4 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRIM35Q9UPQ4 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRIM35Q9UPQ4 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRIM35Q9UPQ4 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRIM35Q9UPQ4 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRIM35Q9UPQ4 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRIM35Q9UPQ4 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRIM35Q9UPQ4 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRIM35Q9UPQ4 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRIM35Q9UPQ4 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRIM35Q9UPQ4 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRIM35Q9UPQ4 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRIM35Q9UPQ4 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRIM35Q9UPQ4 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRIM35Q9UPQ4 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRIM35Q9UPQ4 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRIM35Q9UPQ4 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRIM35Q9UPQ4 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRIM35Q9UPQ4 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRIM35Q9UPQ4 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRIM35Q9UPQ4 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRIM35Q9UPQ4 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRIM35Q9UPQ4 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRIM35Q9UPQ4 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC23.52■■□□□ 1.35
TRIM35Q9UPQ4 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIM35Q9UPQ4 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIM35Q9UPQ4 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIM35Q9UPQ4 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIM35Q9UPQ4 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIM35Q9UPQ4 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIM35Q9UPQ4 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIM35Q9UPQ4 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIM35Q9UPQ4 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIM35Q9UPQ4 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIM35Q9UPQ4 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIM35Q9UPQ4 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIM35Q9UPQ4 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIM35Q9UPQ4 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIM35Q9UPQ4 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIM35Q9UPQ4 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIM35Q9UPQ4 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIM35Q9UPQ4 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIM35Q9UPQ4 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIM35Q9UPQ4 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIM35Q9UPQ4 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIM35Q9UPQ4 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIM35Q9UPQ4 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIM35Q9UPQ4 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM35Q9UPQ4 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM35Q9UPQ4 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM35Q9UPQ4 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM35Q9UPQ4 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM35Q9UPQ4 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM35Q9UPQ4 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM35Q9UPQ4 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM35Q9UPQ4 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM35Q9UPQ4 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM35Q9UPQ4 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM35Q9UPQ4 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM35Q9UPQ4 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM35Q9UPQ4 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM35Q9UPQ4 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM35Q9UPQ4 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM35Q9UPQ4 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM35Q9UPQ4 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM35Q9UPQ4 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM35Q9UPQ4 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM35Q9UPQ4 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM35Q9UPQ4 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM35Q9UPQ4 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM35Q9UPQ4 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM35Q9UPQ4 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM35Q9UPQ4 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM35Q9UPQ4 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM35Q9UPQ4 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM35Q9UPQ4 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM35Q9UPQ4 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM35Q9UPQ4 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM35Q9UPQ4 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM35Q9UPQ4 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM35Q9UPQ4 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM35Q9UPQ4 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM35Q9UPQ4 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM35Q9UPQ4 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM35Q9UPQ4 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM35Q9UPQ4 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM35Q9UPQ4 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM35Q9UPQ4 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM35Q9UPQ4 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM35Q9UPQ4 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM35Q9UPQ4 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM35Q9UPQ4 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM35Q9UPQ4 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM35Q9UPQ4 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM35Q9UPQ4 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
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