Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN75

PCDHA12, Protocadherin alpha-12, humanhuman

Predictions only

Length 941 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHA12Q9UN75 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PCDHA12Q9UN75 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
PCDHA12Q9UN75 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
PCDHA12Q9UN75 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PCDHA12Q9UN75 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PCDHA12Q9UN75 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PCDHA12Q9UN75 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PCDHA12Q9UN75 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PCDHA12Q9UN75 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PCDHA12Q9UN75 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PCDHA12Q9UN75 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PCDHA12Q9UN75 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PCDHA12Q9UN75 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PCDHA12Q9UN75 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PCDHA12Q9UN75 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PCDHA12Q9UN75 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PCDHA12Q9UN75 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PCDHA12Q9UN75 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PCDHA12Q9UN75 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PCDHA12Q9UN75 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PCDHA12Q9UN75 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PCDHA12Q9UN75 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PCDHA12Q9UN75 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PCDHA12Q9UN75 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PCDHA12Q9UN75 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PCDHA12Q9UN75 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PCDHA12Q9UN75 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PCDHA12Q9UN75 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PCDHA12Q9UN75 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PCDHA12Q9UN75 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PCDHA12Q9UN75 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PCDHA12Q9UN75 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PCDHA12Q9UN75 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PCDHA12Q9UN75 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PCDHA12Q9UN75 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PCDHA12Q9UN75 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PCDHA12Q9UN75 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PCDHA12Q9UN75 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PCDHA12Q9UN75 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PCDHA12Q9UN75 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PCDHA12Q9UN75 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PCDHA12Q9UN75 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PCDHA12Q9UN75 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PCDHA12Q9UN75 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PCDHA12Q9UN75 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PCDHA12Q9UN75 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PCDHA12Q9UN75 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
PCDHA12Q9UN75 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PCDHA12Q9UN75 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PCDHA12Q9UN75 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
PCDHA12Q9UN75 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PCDHA12Q9UN75 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PCDHA12Q9UN75 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PCDHA12Q9UN75 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PCDHA12Q9UN75 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PCDHA12Q9UN75 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PCDHA12Q9UN75 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PCDHA12Q9UN75 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PCDHA12Q9UN75 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PCDHA12Q9UN75 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PCDHA12Q9UN75 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PCDHA12Q9UN75 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PCDHA12Q9UN75 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PCDHA12Q9UN75 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PCDHA12Q9UN75 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PCDHA12Q9UN75 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PCDHA12Q9UN75 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PCDHA12Q9UN75 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PCDHA12Q9UN75 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PCDHA12Q9UN75 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PCDHA12Q9UN75 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PCDHA12Q9UN75 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PCDHA12Q9UN75 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
PCDHA12Q9UN75 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PCDHA12Q9UN75 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PCDHA12Q9UN75 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
PCDHA12Q9UN75 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PCDHA12Q9UN75 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
PCDHA12Q9UN75 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PCDHA12Q9UN75 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
PCDHA12Q9UN75 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
PCDHA12Q9UN75 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PCDHA12Q9UN75 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PCDHA12Q9UN75 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PCDHA12Q9UN75 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PCDHA12Q9UN75 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PCDHA12Q9UN75 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PCDHA12Q9UN75 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PCDHA12Q9UN75 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PCDHA12Q9UN75 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PCDHA12Q9UN75 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PCDHA12Q9UN75 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PCDHA12Q9UN75 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PCDHA12Q9UN75 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PCDHA12Q9UN75 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PCDHA12Q9UN75 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PCDHA12Q9UN75 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PCDHA12Q9UN75 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PCDHA12Q9UN75 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
PCDHA12Q9UN75 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms