Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
USP18Q9UMW8 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
USP18Q9UMW8 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
USP18Q9UMW8 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
USP18Q9UMW8 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
USP18Q9UMW8 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
USP18Q9UMW8 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
USP18Q9UMW8 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
USP18Q9UMW8 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
USP18Q9UMW8 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
USP18Q9UMW8 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
USP18Q9UMW8 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
USP18Q9UMW8 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
USP18Q9UMW8 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
USP18Q9UMW8 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
USP18Q9UMW8 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
USP18Q9UMW8 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
USP18Q9UMW8 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
USP18Q9UMW8 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
USP18Q9UMW8 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
USP18Q9UMW8 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
USP18Q9UMW8 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
USP18Q9UMW8 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
USP18Q9UMW8 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
USP18Q9UMW8 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
USP18Q9UMW8 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
USP18Q9UMW8 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
USP18Q9UMW8 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
USP18Q9UMW8 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
USP18Q9UMW8 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
USP18Q9UMW8 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
USP18Q9UMW8 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
USP18Q9UMW8 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
USP18Q9UMW8 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
USP18Q9UMW8 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
USP18Q9UMW8 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
USP18Q9UMW8 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
USP18Q9UMW8 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
USP18Q9UMW8 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
USP18Q9UMW8 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
USP18Q9UMW8 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
USP18Q9UMW8 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
USP18Q9UMW8 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
USP18Q9UMW8 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
USP18Q9UMW8 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
USP18Q9UMW8 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
USP18Q9UMW8 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
USP18Q9UMW8 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
USP18Q9UMW8 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
USP18Q9UMW8 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
USP18Q9UMW8 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
USP18Q9UMW8 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
USP18Q9UMW8 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
USP18Q9UMW8 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
USP18Q9UMW8 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
USP18Q9UMW8 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
USP18Q9UMW8 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
USP18Q9UMW8 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
USP18Q9UMW8 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
USP18Q9UMW8 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
USP18Q9UMW8 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
USP18Q9UMW8 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
USP18Q9UMW8 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
USP18Q9UMW8 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
USP18Q9UMW8 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
USP18Q9UMW8 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
USP18Q9UMW8 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
USP18Q9UMW8 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
USP18Q9UMW8 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
USP18Q9UMW8 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
USP18Q9UMW8 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
USP18Q9UMW8 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
USP18Q9UMW8 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
USP18Q9UMW8 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
USP18Q9UMW8 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
USP18Q9UMW8 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
USP18Q9UMW8 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
USP18Q9UMW8 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
USP18Q9UMW8 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
USP18Q9UMW8 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
USP18Q9UMW8 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
USP18Q9UMW8 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
USP18Q9UMW8 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
USP18Q9UMW8 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
USP18Q9UMW8 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
USP18Q9UMW8 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
USP18Q9UMW8 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
USP18Q9UMW8 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
USP18Q9UMW8 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
USP18Q9UMW8 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
USP18Q9UMW8 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
USP18Q9UMW8 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
USP18Q9UMW8 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
USP18Q9UMW8 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
USP18Q9UMW8 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
USP18Q9UMW8 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
USP18Q9UMW8 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
USP18Q9UMW8 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
USP18Q9UMW8 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
USP18Q9UMW8 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
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