Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULN7

PNMA8B, Paraneoplastic antigen-like protein 8B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA8BQ9ULN7 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PNMA8BQ9ULN7 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PNMA8BQ9ULN7 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PNMA8BQ9ULN7 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PNMA8BQ9ULN7 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PNMA8BQ9ULN7 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PNMA8BQ9ULN7 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PNMA8BQ9ULN7 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PNMA8BQ9ULN7 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PNMA8BQ9ULN7 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PNMA8BQ9ULN7 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PNMA8BQ9ULN7 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PNMA8BQ9ULN7 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PNMA8BQ9ULN7 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PNMA8BQ9ULN7 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PNMA8BQ9ULN7 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PNMA8BQ9ULN7 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PNMA8BQ9ULN7 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PNMA8BQ9ULN7 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PNMA8BQ9ULN7 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PNMA8BQ9ULN7 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PNMA8BQ9ULN7 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PNMA8BQ9ULN7 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PNMA8BQ9ULN7 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PNMA8BQ9ULN7 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PNMA8BQ9ULN7 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PNMA8BQ9ULN7 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PNMA8BQ9ULN7 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PNMA8BQ9ULN7 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PNMA8BQ9ULN7 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PNMA8BQ9ULN7 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PNMA8BQ9ULN7 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PNMA8BQ9ULN7 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PNMA8BQ9ULN7 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PNMA8BQ9ULN7 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PNMA8BQ9ULN7 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PNMA8BQ9ULN7 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PNMA8BQ9ULN7 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PNMA8BQ9ULN7 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PNMA8BQ9ULN7 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PNMA8BQ9ULN7 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
PNMA8BQ9ULN7 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PNMA8BQ9ULN7 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PNMA8BQ9ULN7 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PNMA8BQ9ULN7 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PNMA8BQ9ULN7 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PNMA8BQ9ULN7 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PNMA8BQ9ULN7 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PNMA8BQ9ULN7 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PNMA8BQ9ULN7 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PNMA8BQ9ULN7 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PNMA8BQ9ULN7 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PNMA8BQ9ULN7 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PNMA8BQ9ULN7 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PNMA8BQ9ULN7 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PNMA8BQ9ULN7 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PNMA8BQ9ULN7 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PNMA8BQ9ULN7 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PNMA8BQ9ULN7 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PNMA8BQ9ULN7 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PNMA8BQ9ULN7 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PNMA8BQ9ULN7 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PNMA8BQ9ULN7 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PNMA8BQ9ULN7 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PNMA8BQ9ULN7 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PNMA8BQ9ULN7 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PNMA8BQ9ULN7 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PNMA8BQ9ULN7 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PNMA8BQ9ULN7 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PNMA8BQ9ULN7 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PNMA8BQ9ULN7 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PNMA8BQ9ULN7 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PNMA8BQ9ULN7 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PNMA8BQ9ULN7 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PNMA8BQ9ULN7 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PNMA8BQ9ULN7 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PNMA8BQ9ULN7 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PNMA8BQ9ULN7 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PNMA8BQ9ULN7 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PNMA8BQ9ULN7 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PNMA8BQ9ULN7 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PNMA8BQ9ULN7 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PNMA8BQ9ULN7 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PNMA8BQ9ULN7 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PNMA8BQ9ULN7 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PNMA8BQ9ULN7 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PNMA8BQ9ULN7 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PNMA8BQ9ULN7 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PNMA8BQ9ULN7 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PNMA8BQ9ULN7 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PNMA8BQ9ULN7 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PNMA8BQ9ULN7 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PNMA8BQ9ULN7 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PNMA8BQ9ULN7 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PNMA8BQ9ULN7 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PNMA8BQ9ULN7 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PNMA8BQ9ULN7 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PNMA8BQ9ULN7 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PNMA8BQ9ULN7 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PNMA8BQ9ULN7 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.1 ms