Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULE6

PALD1, Paladin, humanhuman

Predictions only

Length 856 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALD1Q9ULE6 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PALD1Q9ULE6 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PALD1Q9ULE6 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PALD1Q9ULE6 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PALD1Q9ULE6 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PALD1Q9ULE6 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PALD1Q9ULE6 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PALD1Q9ULE6 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PALD1Q9ULE6 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PALD1Q9ULE6 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PALD1Q9ULE6 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PALD1Q9ULE6 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PALD1Q9ULE6 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PALD1Q9ULE6 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PALD1Q9ULE6 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PALD1Q9ULE6 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PALD1Q9ULE6 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PALD1Q9ULE6 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PALD1Q9ULE6 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PALD1Q9ULE6 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PALD1Q9ULE6 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PALD1Q9ULE6 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PALD1Q9ULE6 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PALD1Q9ULE6 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PALD1Q9ULE6 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PALD1Q9ULE6 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PALD1Q9ULE6 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PALD1Q9ULE6 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PALD1Q9ULE6 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PALD1Q9ULE6 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PALD1Q9ULE6 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PALD1Q9ULE6 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PALD1Q9ULE6 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PALD1Q9ULE6 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PALD1Q9ULE6 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PALD1Q9ULE6 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
PALD1Q9ULE6 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PALD1Q9ULE6 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PALD1Q9ULE6 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
PALD1Q9ULE6 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
PALD1Q9ULE6 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PALD1Q9ULE6 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PALD1Q9ULE6 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PALD1Q9ULE6 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PALD1Q9ULE6 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PALD1Q9ULE6 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PALD1Q9ULE6 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PALD1Q9ULE6 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PALD1Q9ULE6 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PALD1Q9ULE6 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PALD1Q9ULE6 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PALD1Q9ULE6 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PALD1Q9ULE6 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PALD1Q9ULE6 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PALD1Q9ULE6 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PALD1Q9ULE6 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PALD1Q9ULE6 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PALD1Q9ULE6 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PALD1Q9ULE6 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PALD1Q9ULE6 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PALD1Q9ULE6 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PALD1Q9ULE6 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PALD1Q9ULE6 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PALD1Q9ULE6 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PALD1Q9ULE6 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PALD1Q9ULE6 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PALD1Q9ULE6 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PALD1Q9ULE6 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PALD1Q9ULE6 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PALD1Q9ULE6 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PALD1Q9ULE6 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PALD1Q9ULE6 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PALD1Q9ULE6 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PALD1Q9ULE6 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PALD1Q9ULE6 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PALD1Q9ULE6 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PALD1Q9ULE6 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PALD1Q9ULE6 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PALD1Q9ULE6 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PALD1Q9ULE6 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PALD1Q9ULE6 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PALD1Q9ULE6 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PALD1Q9ULE6 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PALD1Q9ULE6 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PALD1Q9ULE6 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PALD1Q9ULE6 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PALD1Q9ULE6 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PALD1Q9ULE6 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PALD1Q9ULE6 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PALD1Q9ULE6 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PALD1Q9ULE6 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PALD1Q9ULE6 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PALD1Q9ULE6 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PALD1Q9ULE6 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PALD1Q9ULE6 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PALD1Q9ULE6 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PALD1Q9ULE6 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PALD1Q9ULE6 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PALD1Q9ULE6 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PALD1Q9ULE6 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms