Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULD9

ZNF608, Zinc finger protein 608, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF608Q9ULD9 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
ZNF608Q9ULD9 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
ZNF608Q9ULD9 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
ZNF608Q9ULD9 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
ZNF608Q9ULD9 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
ZNF608Q9ULD9 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
ZNF608Q9ULD9 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
ZNF608Q9ULD9 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
ZNF608Q9ULD9 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
ZNF608Q9ULD9 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC29.73■■■□□ 2.35
ZNF608Q9ULD9 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
ZNF608Q9ULD9 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
ZNF608Q9ULD9 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
ZNF608Q9ULD9 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
ZNF608Q9ULD9 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
ZNF608Q9ULD9 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
ZNF608Q9ULD9 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
ZNF608Q9ULD9 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
ZNF608Q9ULD9 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
ZNF608Q9ULD9 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
ZNF608Q9ULD9 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
ZNF608Q9ULD9 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
ZNF608Q9ULD9 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
ZNF608Q9ULD9 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
ZNF608Q9ULD9 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
ZNF608Q9ULD9 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
ZNF608Q9ULD9 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
ZNF608Q9ULD9 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
ZNF608Q9ULD9 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
ZNF608Q9ULD9 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
ZNF608Q9ULD9 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC29.71■■■□□ 2.35
ZNF608Q9ULD9 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
ZNF608Q9ULD9 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
ZNF608Q9ULD9 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
ZNF608Q9ULD9 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
ZNF608Q9ULD9 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
ZNF608Q9ULD9 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
ZNF608Q9ULD9 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
ZNF608Q9ULD9 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
ZNF608Q9ULD9 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
ZNF608Q9ULD9 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
ZNF608Q9ULD9 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
ZNF608Q9ULD9 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
ZNF608Q9ULD9 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
ZNF608Q9ULD9 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
ZNF608Q9ULD9 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
ZNF608Q9ULD9 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
ZNF608Q9ULD9 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
ZNF608Q9ULD9 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC29.71■■■□□ 2.35
ZNF608Q9ULD9 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
ZNF608Q9ULD9 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC29.71■■■□□ 2.35
ZNF608Q9ULD9 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
ZNF608Q9ULD9 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
ZNF608Q9ULD9 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
ZNF608Q9ULD9 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
ZNF608Q9ULD9 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
ZNF608Q9ULD9 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
ZNF608Q9ULD9 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
ZNF608Q9ULD9 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.34
ZNF608Q9ULD9 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
ZNF608Q9ULD9 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.34
ZNF608Q9ULD9 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC29.7■■■□□ 2.34
ZNF608Q9ULD9 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC29.7■■■□□ 2.34
ZNF608Q9ULD9 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
ZNF608Q9ULD9 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.34
ZNF608Q9ULD9 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.34
ZNF608Q9ULD9 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.34
ZNF608Q9ULD9 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.34
ZNF608Q9ULD9 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
ZNF608Q9ULD9 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.34
ZNF608Q9ULD9 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
ZNF608Q9ULD9 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
ZNF608Q9ULD9 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
ZNF608Q9ULD9 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
ZNF608Q9ULD9 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
ZNF608Q9ULD9 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
ZNF608Q9ULD9 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
ZNF608Q9ULD9 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
ZNF608Q9ULD9 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
ZNF608Q9ULD9 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
ZNF608Q9ULD9 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
ZNF608Q9ULD9 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
ZNF608Q9ULD9 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
ZNF608Q9ULD9 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
ZNF608Q9ULD9 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
ZNF608Q9ULD9 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
ZNF608Q9ULD9 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC29.68■■■□□ 2.34
ZNF608Q9ULD9 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
ZNF608Q9ULD9 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
ZNF608Q9ULD9 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
ZNF608Q9ULD9 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
ZNF608Q9ULD9 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
ZNF608Q9ULD9 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
ZNF608Q9ULD9 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
ZNF608Q9ULD9 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
ZNF608Q9ULD9 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
ZNF608Q9ULD9 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
ZNF608Q9ULD9 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
ZNF608Q9ULD9 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
ZNF608Q9ULD9 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms