Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKI2

CDC42EP3, Cdc42 effector protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP3Q9UKI2 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDC42EP3Q9UKI2 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CDC42EP3Q9UKI2 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDC42EP3Q9UKI2 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDC42EP3Q9UKI2 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDC42EP3Q9UKI2 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDC42EP3Q9UKI2 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDC42EP3Q9UKI2 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDC42EP3Q9UKI2 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDC42EP3Q9UKI2 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDC42EP3Q9UKI2 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CDC42EP3Q9UKI2 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDC42EP3Q9UKI2 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDC42EP3Q9UKI2 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDC42EP3Q9UKI2 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDC42EP3Q9UKI2 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDC42EP3Q9UKI2 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDC42EP3Q9UKI2 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CDC42EP3Q9UKI2 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDC42EP3Q9UKI2 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDC42EP3Q9UKI2 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDC42EP3Q9UKI2 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDC42EP3Q9UKI2 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDC42EP3Q9UKI2 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDC42EP3Q9UKI2 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDC42EP3Q9UKI2 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDC42EP3Q9UKI2 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDC42EP3Q9UKI2 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDC42EP3Q9UKI2 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDC42EP3Q9UKI2 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDC42EP3Q9UKI2 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDC42EP3Q9UKI2 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDC42EP3Q9UKI2 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDC42EP3Q9UKI2 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDC42EP3Q9UKI2 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDC42EP3Q9UKI2 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDC42EP3Q9UKI2 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDC42EP3Q9UKI2 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDC42EP3Q9UKI2 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDC42EP3Q9UKI2 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDC42EP3Q9UKI2 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDC42EP3Q9UKI2 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDC42EP3Q9UKI2 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDC42EP3Q9UKI2 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CDC42EP3Q9UKI2 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDC42EP3Q9UKI2 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDC42EP3Q9UKI2 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDC42EP3Q9UKI2 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDC42EP3Q9UKI2 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDC42EP3Q9UKI2 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDC42EP3Q9UKI2 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDC42EP3Q9UKI2 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDC42EP3Q9UKI2 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CDC42EP3Q9UKI2 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDC42EP3Q9UKI2 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDC42EP3Q9UKI2 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDC42EP3Q9UKI2 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDC42EP3Q9UKI2 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDC42EP3Q9UKI2 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDC42EP3Q9UKI2 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDC42EP3Q9UKI2 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDC42EP3Q9UKI2 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDC42EP3Q9UKI2 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDC42EP3Q9UKI2 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDC42EP3Q9UKI2 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CDC42EP3Q9UKI2 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CDC42EP3Q9UKI2 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDC42EP3Q9UKI2 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDC42EP3Q9UKI2 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDC42EP3Q9UKI2 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDC42EP3Q9UKI2 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDC42EP3Q9UKI2 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDC42EP3Q9UKI2 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDC42EP3Q9UKI2 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDC42EP3Q9UKI2 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDC42EP3Q9UKI2 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDC42EP3Q9UKI2 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDC42EP3Q9UKI2 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CDC42EP3Q9UKI2 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CDC42EP3Q9UKI2 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDC42EP3Q9UKI2 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDC42EP3Q9UKI2 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDC42EP3Q9UKI2 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDC42EP3Q9UKI2 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDC42EP3Q9UKI2 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDC42EP3Q9UKI2 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDC42EP3Q9UKI2 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDC42EP3Q9UKI2 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDC42EP3Q9UKI2 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDC42EP3Q9UKI2 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDC42EP3Q9UKI2 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDC42EP3Q9UKI2 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDC42EP3Q9UKI2 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDC42EP3Q9UKI2 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDC42EP3Q9UKI2 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDC42EP3Q9UKI2 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDC42EP3Q9UKI2 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDC42EP3Q9UKI2 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDC42EP3Q9UKI2 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDC42EP3Q9UKI2 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms