Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKA8

RCAN3, Calcipressin-3, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCAN3Q9UKA8 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RCAN3Q9UKA8 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RCAN3Q9UKA8 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RCAN3Q9UKA8 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RCAN3Q9UKA8 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RCAN3Q9UKA8 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RCAN3Q9UKA8 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RCAN3Q9UKA8 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RCAN3Q9UKA8 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RCAN3Q9UKA8 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RCAN3Q9UKA8 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RCAN3Q9UKA8 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RCAN3Q9UKA8 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
RCAN3Q9UKA8 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RCAN3Q9UKA8 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RCAN3Q9UKA8 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RCAN3Q9UKA8 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RCAN3Q9UKA8 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
RCAN3Q9UKA8 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RCAN3Q9UKA8 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
RCAN3Q9UKA8 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RCAN3Q9UKA8 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RCAN3Q9UKA8 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RCAN3Q9UKA8 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RCAN3Q9UKA8 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
RCAN3Q9UKA8 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RCAN3Q9UKA8 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RCAN3Q9UKA8 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RCAN3Q9UKA8 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RCAN3Q9UKA8 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RCAN3Q9UKA8 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RCAN3Q9UKA8 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RCAN3Q9UKA8 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RCAN3Q9UKA8 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RCAN3Q9UKA8 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RCAN3Q9UKA8 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RCAN3Q9UKA8 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RCAN3Q9UKA8 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RCAN3Q9UKA8 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RCAN3Q9UKA8 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RCAN3Q9UKA8 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RCAN3Q9UKA8 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RCAN3Q9UKA8 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RCAN3Q9UKA8 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RCAN3Q9UKA8 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RCAN3Q9UKA8 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RCAN3Q9UKA8 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RCAN3Q9UKA8 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RCAN3Q9UKA8 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RCAN3Q9UKA8 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RCAN3Q9UKA8 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RCAN3Q9UKA8 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RCAN3Q9UKA8 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RCAN3Q9UKA8 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RCAN3Q9UKA8 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RCAN3Q9UKA8 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RCAN3Q9UKA8 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RCAN3Q9UKA8 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RCAN3Q9UKA8 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RCAN3Q9UKA8 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RCAN3Q9UKA8 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RCAN3Q9UKA8 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RCAN3Q9UKA8 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RCAN3Q9UKA8 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RCAN3Q9UKA8 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RCAN3Q9UKA8 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RCAN3Q9UKA8 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RCAN3Q9UKA8 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RCAN3Q9UKA8 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RCAN3Q9UKA8 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RCAN3Q9UKA8 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RCAN3Q9UKA8 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RCAN3Q9UKA8 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RCAN3Q9UKA8 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RCAN3Q9UKA8 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RCAN3Q9UKA8 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RCAN3Q9UKA8 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RCAN3Q9UKA8 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RCAN3Q9UKA8 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RCAN3Q9UKA8 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RCAN3Q9UKA8 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
RCAN3Q9UKA8 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RCAN3Q9UKA8 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RCAN3Q9UKA8 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RCAN3Q9UKA8 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RCAN3Q9UKA8 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RCAN3Q9UKA8 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RCAN3Q9UKA8 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RCAN3Q9UKA8 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RCAN3Q9UKA8 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RCAN3Q9UKA8 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RCAN3Q9UKA8 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RCAN3Q9UKA8 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RCAN3Q9UKA8 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RCAN3Q9UKA8 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RCAN3Q9UKA8 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RCAN3Q9UKA8 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RCAN3Q9UKA8 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RCAN3Q9UKA8 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RCAN3Q9UKA8 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms