Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC9

NPC1L1, Niemann-Pick C1-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPC1L1Q9UHC9 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NPC1L1Q9UHC9 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NPC1L1Q9UHC9 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NPC1L1Q9UHC9 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
NPC1L1Q9UHC9 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NPC1L1Q9UHC9 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
NPC1L1Q9UHC9 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NPC1L1Q9UHC9 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NPC1L1Q9UHC9 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NPC1L1Q9UHC9 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NPC1L1Q9UHC9 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NPC1L1Q9UHC9 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NPC1L1Q9UHC9 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NPC1L1Q9UHC9 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NPC1L1Q9UHC9 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NPC1L1Q9UHC9 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NPC1L1Q9UHC9 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NPC1L1Q9UHC9 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NPC1L1Q9UHC9 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NPC1L1Q9UHC9 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NPC1L1Q9UHC9 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NPC1L1Q9UHC9 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NPC1L1Q9UHC9 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NPC1L1Q9UHC9 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NPC1L1Q9UHC9 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NPC1L1Q9UHC9 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NPC1L1Q9UHC9 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NPC1L1Q9UHC9 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NPC1L1Q9UHC9 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NPC1L1Q9UHC9 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NPC1L1Q9UHC9 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NPC1L1Q9UHC9 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NPC1L1Q9UHC9 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NPC1L1Q9UHC9 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NPC1L1Q9UHC9 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NPC1L1Q9UHC9 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NPC1L1Q9UHC9 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NPC1L1Q9UHC9 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NPC1L1Q9UHC9 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NPC1L1Q9UHC9 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NPC1L1Q9UHC9 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NPC1L1Q9UHC9 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NPC1L1Q9UHC9 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NPC1L1Q9UHC9 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NPC1L1Q9UHC9 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NPC1L1Q9UHC9 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
NPC1L1Q9UHC9 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
NPC1L1Q9UHC9 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
NPC1L1Q9UHC9 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NPC1L1Q9UHC9 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NPC1L1Q9UHC9 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NPC1L1Q9UHC9 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NPC1L1Q9UHC9 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NPC1L1Q9UHC9 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NPC1L1Q9UHC9 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NPC1L1Q9UHC9 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NPC1L1Q9UHC9 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NPC1L1Q9UHC9 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NPC1L1Q9UHC9 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NPC1L1Q9UHC9 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NPC1L1Q9UHC9 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NPC1L1Q9UHC9 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NPC1L1Q9UHC9 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
NPC1L1Q9UHC9 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
NPC1L1Q9UHC9 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
NPC1L1Q9UHC9 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NPC1L1Q9UHC9 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NPC1L1Q9UHC9 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
NPC1L1Q9UHC9 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NPC1L1Q9UHC9 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NPC1L1Q9UHC9 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NPC1L1Q9UHC9 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NPC1L1Q9UHC9 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NPC1L1Q9UHC9 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NPC1L1Q9UHC9 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
NPC1L1Q9UHC9 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NPC1L1Q9UHC9 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NPC1L1Q9UHC9 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NPC1L1Q9UHC9 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
NPC1L1Q9UHC9 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
NPC1L1Q9UHC9 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NPC1L1Q9UHC9 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NPC1L1Q9UHC9 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NPC1L1Q9UHC9 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
NPC1L1Q9UHC9 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NPC1L1Q9UHC9 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NPC1L1Q9UHC9 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NPC1L1Q9UHC9 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NPC1L1Q9UHC9 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NPC1L1Q9UHC9 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NPC1L1Q9UHC9 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NPC1L1Q9UHC9 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NPC1L1Q9UHC9 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NPC1L1Q9UHC9 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NPC1L1Q9UHC9 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NPC1L1Q9UHC9 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NPC1L1Q9UHC9 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NPC1L1Q9UHC9 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NPC1L1Q9UHC9 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NPC1L1Q9UHC9 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms