Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGL1

KDM5B, Lysine-specific demethylase 5B, humanhuman

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5BQ9UGL1 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC28.07■■■□□ 2.08
KDM5BQ9UGL1 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
KDM5BQ9UGL1 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
KDM5BQ9UGL1 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
KDM5BQ9UGL1 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
KDM5BQ9UGL1 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
KDM5BQ9UGL1 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
KDM5BQ9UGL1 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
KDM5BQ9UGL1 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
KDM5BQ9UGL1 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
KDM5BQ9UGL1 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
KDM5BQ9UGL1 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
KDM5BQ9UGL1 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
KDM5BQ9UGL1 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
KDM5BQ9UGL1 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
KDM5BQ9UGL1 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
KDM5BQ9UGL1 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
KDM5BQ9UGL1 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
KDM5BQ9UGL1 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
KDM5BQ9UGL1 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
KDM5BQ9UGL1 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
KDM5BQ9UGL1 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
KDM5BQ9UGL1 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC28.06■■■□□ 2.08
KDM5BQ9UGL1 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
KDM5BQ9UGL1 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
KDM5BQ9UGL1 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
KDM5BQ9UGL1 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
KDM5BQ9UGL1 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
KDM5BQ9UGL1 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
KDM5BQ9UGL1 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
KDM5BQ9UGL1 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
KDM5BQ9UGL1 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
KDM5BQ9UGL1 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
KDM5BQ9UGL1 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
KDM5BQ9UGL1 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
KDM5BQ9UGL1 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
KDM5BQ9UGL1 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
KDM5BQ9UGL1 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
KDM5BQ9UGL1 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
KDM5BQ9UGL1 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
KDM5BQ9UGL1 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
KDM5BQ9UGL1 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
KDM5BQ9UGL1 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
KDM5BQ9UGL1 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
KDM5BQ9UGL1 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
KDM5BQ9UGL1 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
KDM5BQ9UGL1 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
KDM5BQ9UGL1 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
KDM5BQ9UGL1 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
KDM5BQ9UGL1 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
KDM5BQ9UGL1 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
KDM5BQ9UGL1 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC28.04■■■□□ 2.08
KDM5BQ9UGL1 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
KDM5BQ9UGL1 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
KDM5BQ9UGL1 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
KDM5BQ9UGL1 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
KDM5BQ9UGL1 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
KDM5BQ9UGL1 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
KDM5BQ9UGL1 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
KDM5BQ9UGL1 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
KDM5BQ9UGL1 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
KDM5BQ9UGL1 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
KDM5BQ9UGL1 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
KDM5BQ9UGL1 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
KDM5BQ9UGL1 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
KDM5BQ9UGL1 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
KDM5BQ9UGL1 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
KDM5BQ9UGL1 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
KDM5BQ9UGL1 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
KDM5BQ9UGL1 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
KDM5BQ9UGL1 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
KDM5BQ9UGL1 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
KDM5BQ9UGL1 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
KDM5BQ9UGL1 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
KDM5BQ9UGL1 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
KDM5BQ9UGL1 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
KDM5BQ9UGL1 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
KDM5BQ9UGL1 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
KDM5BQ9UGL1 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
KDM5BQ9UGL1 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
KDM5BQ9UGL1 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC28.02■■■□□ 2.08
KDM5BQ9UGL1 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
KDM5BQ9UGL1 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
KDM5BQ9UGL1 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
KDM5BQ9UGL1 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
KDM5BQ9UGL1 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
KDM5BQ9UGL1 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
KDM5BQ9UGL1 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
KDM5BQ9UGL1 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
KDM5BQ9UGL1 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
KDM5BQ9UGL1 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
KDM5BQ9UGL1 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
KDM5BQ9UGL1 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
KDM5BQ9UGL1 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
KDM5BQ9UGL1 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
KDM5BQ9UGL1 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
KDM5BQ9UGL1 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
KDM5BQ9UGL1 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
KDM5BQ9UGL1 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
KDM5BQ9UGL1 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms