Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

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Length 275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
COPS7AQ9UBW8 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
COPS7AQ9UBW8 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
COPS7AQ9UBW8 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
COPS7AQ9UBW8 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
COPS7AQ9UBW8 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
COPS7AQ9UBW8 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
COPS7AQ9UBW8 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
COPS7AQ9UBW8 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
COPS7AQ9UBW8 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
COPS7AQ9UBW8 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
COPS7AQ9UBW8 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
COPS7AQ9UBW8 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
COPS7AQ9UBW8 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
COPS7AQ9UBW8 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
COPS7AQ9UBW8 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
COPS7AQ9UBW8 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
COPS7AQ9UBW8 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
COPS7AQ9UBW8 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
COPS7AQ9UBW8 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
COPS7AQ9UBW8 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
COPS7AQ9UBW8 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
COPS7AQ9UBW8 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
COPS7AQ9UBW8 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
COPS7AQ9UBW8 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
COPS7AQ9UBW8 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
COPS7AQ9UBW8 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
COPS7AQ9UBW8 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
COPS7AQ9UBW8 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
COPS7AQ9UBW8 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
COPS7AQ9UBW8 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
COPS7AQ9UBW8 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
COPS7AQ9UBW8 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
COPS7AQ9UBW8 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
COPS7AQ9UBW8 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
COPS7AQ9UBW8 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
COPS7AQ9UBW8 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
COPS7AQ9UBW8 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
COPS7AQ9UBW8 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
COPS7AQ9UBW8 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
COPS7AQ9UBW8 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
COPS7AQ9UBW8 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
COPS7AQ9UBW8 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
COPS7AQ9UBW8 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
COPS7AQ9UBW8 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
COPS7AQ9UBW8 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
COPS7AQ9UBW8 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
COPS7AQ9UBW8 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
COPS7AQ9UBW8 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
COPS7AQ9UBW8 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
COPS7AQ9UBW8 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
COPS7AQ9UBW8 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
COPS7AQ9UBW8 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
COPS7AQ9UBW8 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
COPS7AQ9UBW8 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
COPS7AQ9UBW8 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
COPS7AQ9UBW8 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
COPS7AQ9UBW8 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
COPS7AQ9UBW8 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
COPS7AQ9UBW8 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
COPS7AQ9UBW8 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
COPS7AQ9UBW8 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
COPS7AQ9UBW8 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
COPS7AQ9UBW8 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
COPS7AQ9UBW8 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
COPS7AQ9UBW8 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
COPS7AQ9UBW8 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
COPS7AQ9UBW8 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
COPS7AQ9UBW8 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
COPS7AQ9UBW8 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
COPS7AQ9UBW8 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
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COPS7AQ9UBW8 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
COPS7AQ9UBW8 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
COPS7AQ9UBW8 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
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COPS7AQ9UBW8 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
COPS7AQ9UBW8 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
COPS7AQ9UBW8 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
COPS7AQ9UBW8 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
COPS7AQ9UBW8 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
COPS7AQ9UBW8 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
COPS7AQ9UBW8 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
COPS7AQ9UBW8 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
COPS7AQ9UBW8 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
COPS7AQ9UBW8 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
COPS7AQ9UBW8 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
COPS7AQ9UBW8 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
COPS7AQ9UBW8 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
COPS7AQ9UBW8 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
COPS7AQ9UBW8 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
COPS7AQ9UBW8 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
COPS7AQ9UBW8 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
COPS7AQ9UBW8 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
COPS7AQ9UBW8 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
COPS7AQ9UBW8 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
COPS7AQ9UBW8 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
COPS7AQ9UBW8 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
COPS7AQ9UBW8 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
COPS7AQ9UBW8 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
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