Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT7

CTNNAL1, Alpha-catulin, humanhuman

Predictions only

Length 734 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNAL1Q9UBT7 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTNNAL1Q9UBT7 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTNNAL1Q9UBT7 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTNNAL1Q9UBT7 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTNNAL1Q9UBT7 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTNNAL1Q9UBT7 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CTNNAL1Q9UBT7 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CTNNAL1Q9UBT7 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CTNNAL1Q9UBT7 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTNNAL1Q9UBT7 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTNNAL1Q9UBT7 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTNNAL1Q9UBT7 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTNNAL1Q9UBT7 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CTNNAL1Q9UBT7 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTNNAL1Q9UBT7 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTNNAL1Q9UBT7 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTNNAL1Q9UBT7 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTNNAL1Q9UBT7 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTNNAL1Q9UBT7 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTNNAL1Q9UBT7 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTNNAL1Q9UBT7 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTNNAL1Q9UBT7 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTNNAL1Q9UBT7 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTNNAL1Q9UBT7 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTNNAL1Q9UBT7 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTNNAL1Q9UBT7 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTNNAL1Q9UBT7 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTNNAL1Q9UBT7 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
CTNNAL1Q9UBT7 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTNNAL1Q9UBT7 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTNNAL1Q9UBT7 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTNNAL1Q9UBT7 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTNNAL1Q9UBT7 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTNNAL1Q9UBT7 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTNNAL1Q9UBT7 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTNNAL1Q9UBT7 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTNNAL1Q9UBT7 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTNNAL1Q9UBT7 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTNNAL1Q9UBT7 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTNNAL1Q9UBT7 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTNNAL1Q9UBT7 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTNNAL1Q9UBT7 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTNNAL1Q9UBT7 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTNNAL1Q9UBT7 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTNNAL1Q9UBT7 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTNNAL1Q9UBT7 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTNNAL1Q9UBT7 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTNNAL1Q9UBT7 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTNNAL1Q9UBT7 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTNNAL1Q9UBT7 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTNNAL1Q9UBT7 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTNNAL1Q9UBT7 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTNNAL1Q9UBT7 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTNNAL1Q9UBT7 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTNNAL1Q9UBT7 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTNNAL1Q9UBT7 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTNNAL1Q9UBT7 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTNNAL1Q9UBT7 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTNNAL1Q9UBT7 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTNNAL1Q9UBT7 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTNNAL1Q9UBT7 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTNNAL1Q9UBT7 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTNNAL1Q9UBT7 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTNNAL1Q9UBT7 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTNNAL1Q9UBT7 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTNNAL1Q9UBT7 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTNNAL1Q9UBT7 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTNNAL1Q9UBT7 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CTNNAL1Q9UBT7 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTNNAL1Q9UBT7 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTNNAL1Q9UBT7 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTNNAL1Q9UBT7 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTNNAL1Q9UBT7 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTNNAL1Q9UBT7 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTNNAL1Q9UBT7 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTNNAL1Q9UBT7 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTNNAL1Q9UBT7 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CTNNAL1Q9UBT7 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CTNNAL1Q9UBT7 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CTNNAL1Q9UBT7 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTNNAL1Q9UBT7 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTNNAL1Q9UBT7 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CTNNAL1Q9UBT7 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTNNAL1Q9UBT7 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTNNAL1Q9UBT7 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTNNAL1Q9UBT7 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTNNAL1Q9UBT7 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTNNAL1Q9UBT7 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTNNAL1Q9UBT7 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTNNAL1Q9UBT7 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTNNAL1Q9UBT7 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTNNAL1Q9UBT7 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CTNNAL1Q9UBT7 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CTNNAL1Q9UBT7 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTNNAL1Q9UBT7 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTNNAL1Q9UBT7 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTNNAL1Q9UBT7 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTNNAL1Q9UBT7 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTNNAL1Q9UBT7 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTNNAL1Q9UBT7 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms