Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBQ6

EXTL2, Exostosin-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXTL2Q9UBQ6 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
EXTL2Q9UBQ6 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
EXTL2Q9UBQ6 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
EXTL2Q9UBQ6 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
EXTL2Q9UBQ6 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
EXTL2Q9UBQ6 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
EXTL2Q9UBQ6 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
EXTL2Q9UBQ6 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
EXTL2Q9UBQ6 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
EXTL2Q9UBQ6 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
EXTL2Q9UBQ6 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
EXTL2Q9UBQ6 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
EXTL2Q9UBQ6 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
EXTL2Q9UBQ6 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
EXTL2Q9UBQ6 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
EXTL2Q9UBQ6 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
EXTL2Q9UBQ6 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
EXTL2Q9UBQ6 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
EXTL2Q9UBQ6 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
EXTL2Q9UBQ6 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
EXTL2Q9UBQ6 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
EXTL2Q9UBQ6 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EXTL2Q9UBQ6 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EXTL2Q9UBQ6 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EXTL2Q9UBQ6 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
EXTL2Q9UBQ6 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EXTL2Q9UBQ6 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
EXTL2Q9UBQ6 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
EXTL2Q9UBQ6 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
EXTL2Q9UBQ6 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EXTL2Q9UBQ6 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
EXTL2Q9UBQ6 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
EXTL2Q9UBQ6 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
EXTL2Q9UBQ6 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
EXTL2Q9UBQ6 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EXTL2Q9UBQ6 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
EXTL2Q9UBQ6 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
EXTL2Q9UBQ6 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
EXTL2Q9UBQ6 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EXTL2Q9UBQ6 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
EXTL2Q9UBQ6 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EXTL2Q9UBQ6 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
EXTL2Q9UBQ6 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
EXTL2Q9UBQ6 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EXTL2Q9UBQ6 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
EXTL2Q9UBQ6 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EXTL2Q9UBQ6 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EXTL2Q9UBQ6 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
EXTL2Q9UBQ6 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EXTL2Q9UBQ6 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EXTL2Q9UBQ6 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EXTL2Q9UBQ6 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EXTL2Q9UBQ6 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EXTL2Q9UBQ6 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EXTL2Q9UBQ6 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EXTL2Q9UBQ6 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EXTL2Q9UBQ6 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EXTL2Q9UBQ6 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EXTL2Q9UBQ6 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EXTL2Q9UBQ6 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EXTL2Q9UBQ6 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EXTL2Q9UBQ6 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EXTL2Q9UBQ6 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EXTL2Q9UBQ6 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EXTL2Q9UBQ6 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EXTL2Q9UBQ6 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EXTL2Q9UBQ6 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EXTL2Q9UBQ6 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EXTL2Q9UBQ6 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EXTL2Q9UBQ6 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EXTL2Q9UBQ6 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EXTL2Q9UBQ6 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EXTL2Q9UBQ6 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EXTL2Q9UBQ6 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EXTL2Q9UBQ6 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EXTL2Q9UBQ6 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EXTL2Q9UBQ6 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EXTL2Q9UBQ6 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EXTL2Q9UBQ6 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EXTL2Q9UBQ6 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EXTL2Q9UBQ6 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EXTL2Q9UBQ6 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EXTL2Q9UBQ6 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EXTL2Q9UBQ6 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EXTL2Q9UBQ6 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EXTL2Q9UBQ6 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EXTL2Q9UBQ6 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EXTL2Q9UBQ6 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EXTL2Q9UBQ6 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
EXTL2Q9UBQ6 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EXTL2Q9UBQ6 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EXTL2Q9UBQ6 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EXTL2Q9UBQ6 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EXTL2Q9UBQ6 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EXTL2Q9UBQ6 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EXTL2Q9UBQ6 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EXTL2Q9UBQ6 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EXTL2Q9UBQ6 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EXTL2Q9UBQ6 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EXTL2Q9UBQ6 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms