Protein–RNA interactions for Protein: Q9P219

CCDC88C, Protein Daple, humanhuman

Predictions only

Length 2,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC88CQ9P219 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC88CQ9P219 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC88CQ9P219 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC88CQ9P219 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC88CQ9P219 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC88CQ9P219 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC88CQ9P219 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC88CQ9P219 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC88CQ9P219 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC88CQ9P219 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC88CQ9P219 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC88CQ9P219 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC88CQ9P219 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC88CQ9P219 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC88CQ9P219 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC88CQ9P219 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC88CQ9P219 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC88CQ9P219 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC88CQ9P219 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC88CQ9P219 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC88CQ9P219 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC88CQ9P219 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC88CQ9P219 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC88CQ9P219 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC88CQ9P219 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC88CQ9P219 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC88CQ9P219 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC88CQ9P219 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC88CQ9P219 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC88CQ9P219 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC88CQ9P219 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC88CQ9P219 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC88CQ9P219 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC88CQ9P219 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC88CQ9P219 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC88CQ9P219 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC88CQ9P219 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC88CQ9P219 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC88CQ9P219 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC88CQ9P219 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC88CQ9P219 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC88CQ9P219 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC88CQ9P219 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC88CQ9P219 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC88CQ9P219 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC88CQ9P219 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC88CQ9P219 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC88CQ9P219 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC88CQ9P219 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC88CQ9P219 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC88CQ9P219 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC88CQ9P219 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC88CQ9P219 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC88CQ9P219 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC88CQ9P219 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC88CQ9P219 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC88CQ9P219 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC88CQ9P219 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC88CQ9P219 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC88CQ9P219 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC88CQ9P219 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC88CQ9P219 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC88CQ9P219 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC88CQ9P219 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC88CQ9P219 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC88CQ9P219 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC88CQ9P219 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC88CQ9P219 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC88CQ9P219 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC88CQ9P219 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC88CQ9P219 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC88CQ9P219 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC88CQ9P219 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC88CQ9P219 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC88CQ9P219 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC88CQ9P219 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC88CQ9P219 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC88CQ9P219 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC88CQ9P219 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC88CQ9P219 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC88CQ9P219 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC88CQ9P219 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC88CQ9P219 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC88CQ9P219 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC88CQ9P219 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC88CQ9P219 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC88CQ9P219 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC88CQ9P219 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC88CQ9P219 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC88CQ9P219 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC88CQ9P219 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC88CQ9P219 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC88CQ9P219 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC88CQ9P219 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC88CQ9P219 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC88CQ9P219 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC88CQ9P219 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CCDC88CQ9P219 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CCDC88CQ9P219 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CCDC88CQ9P219 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms