Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SH3BP4Q9P0V3 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SH3BP4Q9P0V3 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SH3BP4Q9P0V3 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SH3BP4Q9P0V3 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SH3BP4Q9P0V3 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SH3BP4Q9P0V3 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SH3BP4Q9P0V3 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SH3BP4Q9P0V3 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SH3BP4Q9P0V3 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SH3BP4Q9P0V3 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SH3BP4Q9P0V3 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SH3BP4Q9P0V3 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SH3BP4Q9P0V3 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SH3BP4Q9P0V3 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SH3BP4Q9P0V3 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SH3BP4Q9P0V3 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SH3BP4Q9P0V3 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SH3BP4Q9P0V3 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SH3BP4Q9P0V3 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SH3BP4Q9P0V3 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SH3BP4Q9P0V3 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SH3BP4Q9P0V3 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SH3BP4Q9P0V3 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SH3BP4Q9P0V3 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SH3BP4Q9P0V3 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SH3BP4Q9P0V3 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SH3BP4Q9P0V3 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SH3BP4Q9P0V3 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SH3BP4Q9P0V3 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SH3BP4Q9P0V3 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SH3BP4Q9P0V3 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SH3BP4Q9P0V3 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SH3BP4Q9P0V3 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SH3BP4Q9P0V3 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
SH3BP4Q9P0V3 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SH3BP4Q9P0V3 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SH3BP4Q9P0V3 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SH3BP4Q9P0V3 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
SH3BP4Q9P0V3 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SH3BP4Q9P0V3 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SH3BP4Q9P0V3 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SH3BP4Q9P0V3 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SH3BP4Q9P0V3 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SH3BP4Q9P0V3 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SH3BP4Q9P0V3 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
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SH3BP4Q9P0V3 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SH3BP4Q9P0V3 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SH3BP4Q9P0V3 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SH3BP4Q9P0V3 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SH3BP4Q9P0V3 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SH3BP4Q9P0V3 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SH3BP4Q9P0V3 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SH3BP4Q9P0V3 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SH3BP4Q9P0V3 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SH3BP4Q9P0V3 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SH3BP4Q9P0V3 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SH3BP4Q9P0V3 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SH3BP4Q9P0V3 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SH3BP4Q9P0V3 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SH3BP4Q9P0V3 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SH3BP4Q9P0V3 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SH3BP4Q9P0V3 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SH3BP4Q9P0V3 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
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SH3BP4Q9P0V3 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SH3BP4Q9P0V3 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SH3BP4Q9P0V3 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
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SH3BP4Q9P0V3 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SH3BP4Q9P0V3 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SH3BP4Q9P0V3 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SH3BP4Q9P0V3 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SH3BP4Q9P0V3 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SH3BP4Q9P0V3 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SH3BP4Q9P0V3 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SH3BP4Q9P0V3 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SH3BP4Q9P0V3 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SH3BP4Q9P0V3 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SH3BP4Q9P0V3 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SH3BP4Q9P0V3 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SH3BP4Q9P0V3 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SH3BP4Q9P0V3 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SH3BP4Q9P0V3 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SH3BP4Q9P0V3 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SH3BP4Q9P0V3 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SH3BP4Q9P0V3 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SH3BP4Q9P0V3 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SH3BP4Q9P0V3 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SH3BP4Q9P0V3 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SH3BP4Q9P0V3 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SH3BP4Q9P0V3 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SH3BP4Q9P0V3 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SH3BP4Q9P0V3 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SH3BP4Q9P0V3 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SH3BP4Q9P0V3 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
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