Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN3

EHD3, EH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD3Q9NZN3 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
EHD3Q9NZN3 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
EHD3Q9NZN3 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
EHD3Q9NZN3 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
EHD3Q9NZN3 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
EHD3Q9NZN3 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
EHD3Q9NZN3 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
EHD3Q9NZN3 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
EHD3Q9NZN3 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
EHD3Q9NZN3 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EHD3Q9NZN3 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EHD3Q9NZN3 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EHD3Q9NZN3 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EHD3Q9NZN3 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
EHD3Q9NZN3 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EHD3Q9NZN3 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
EHD3Q9NZN3 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EHD3Q9NZN3 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EHD3Q9NZN3 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EHD3Q9NZN3 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
EHD3Q9NZN3 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EHD3Q9NZN3 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EHD3Q9NZN3 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EHD3Q9NZN3 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
EHD3Q9NZN3 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EHD3Q9NZN3 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
EHD3Q9NZN3 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
EHD3Q9NZN3 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EHD3Q9NZN3 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
EHD3Q9NZN3 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
EHD3Q9NZN3 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
EHD3Q9NZN3 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
EHD3Q9NZN3 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
EHD3Q9NZN3 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
EHD3Q9NZN3 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
EHD3Q9NZN3 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EHD3Q9NZN3 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
EHD3Q9NZN3 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EHD3Q9NZN3 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
EHD3Q9NZN3 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EHD3Q9NZN3 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EHD3Q9NZN3 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
EHD3Q9NZN3 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EHD3Q9NZN3 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EHD3Q9NZN3 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
EHD3Q9NZN3 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
EHD3Q9NZN3 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
EHD3Q9NZN3 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
EHD3Q9NZN3 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
EHD3Q9NZN3 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EHD3Q9NZN3 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
EHD3Q9NZN3 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
EHD3Q9NZN3 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
EHD3Q9NZN3 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
EHD3Q9NZN3 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
EHD3Q9NZN3 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
EHD3Q9NZN3 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
EHD3Q9NZN3 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EHD3Q9NZN3 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EHD3Q9NZN3 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EHD3Q9NZN3 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EHD3Q9NZN3 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EHD3Q9NZN3 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
EHD3Q9NZN3 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
EHD3Q9NZN3 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
EHD3Q9NZN3 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EHD3Q9NZN3 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EHD3Q9NZN3 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EHD3Q9NZN3 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EHD3Q9NZN3 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EHD3Q9NZN3 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EHD3Q9NZN3 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EHD3Q9NZN3 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EHD3Q9NZN3 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
EHD3Q9NZN3 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EHD3Q9NZN3 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
EHD3Q9NZN3 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
EHD3Q9NZN3 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
EHD3Q9NZN3 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
EHD3Q9NZN3 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
EHD3Q9NZN3 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
EHD3Q9NZN3 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EHD3Q9NZN3 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
EHD3Q9NZN3 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
EHD3Q9NZN3 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EHD3Q9NZN3 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
EHD3Q9NZN3 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EHD3Q9NZN3 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
EHD3Q9NZN3 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
EHD3Q9NZN3 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EHD3Q9NZN3 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EHD3Q9NZN3 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
EHD3Q9NZN3 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
EHD3Q9NZN3 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
EHD3Q9NZN3 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
EHD3Q9NZN3 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
EHD3Q9NZN3 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
EHD3Q9NZN3 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
EHD3Q9NZN3 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
EHD3Q9NZN3 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms