Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYG2

ZDHHC3, Palmitoyltransferase ZDHHC3, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZDHHC3Q9NYG2 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZDHHC3Q9NYG2 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZDHHC3Q9NYG2 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZDHHC3Q9NYG2 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZDHHC3Q9NYG2 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZDHHC3Q9NYG2 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZDHHC3Q9NYG2 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZDHHC3Q9NYG2 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZDHHC3Q9NYG2 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZDHHC3Q9NYG2 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
ZDHHC3Q9NYG2 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZDHHC3Q9NYG2 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZDHHC3Q9NYG2 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
ZDHHC3Q9NYG2 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZDHHC3Q9NYG2 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZDHHC3Q9NYG2 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZDHHC3Q9NYG2 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
ZDHHC3Q9NYG2 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZDHHC3Q9NYG2 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZDHHC3Q9NYG2 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZDHHC3Q9NYG2 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZDHHC3Q9NYG2 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZDHHC3Q9NYG2 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZDHHC3Q9NYG2 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZDHHC3Q9NYG2 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
ZDHHC3Q9NYG2 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
ZDHHC3Q9NYG2 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ZDHHC3Q9NYG2 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ZDHHC3Q9NYG2 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ZDHHC3Q9NYG2 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ZDHHC3Q9NYG2 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ZDHHC3Q9NYG2 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ZDHHC3Q9NYG2 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ZDHHC3Q9NYG2 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ZDHHC3Q9NYG2 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ZDHHC3Q9NYG2 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ZDHHC3Q9NYG2 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ZDHHC3Q9NYG2 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ZDHHC3Q9NYG2 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ZDHHC3Q9NYG2 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ZDHHC3Q9NYG2 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ZDHHC3Q9NYG2 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ZDHHC3Q9NYG2 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ZDHHC3Q9NYG2 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ZDHHC3Q9NYG2 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ZDHHC3Q9NYG2 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ZDHHC3Q9NYG2 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ZDHHC3Q9NYG2 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ZDHHC3Q9NYG2 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
ZDHHC3Q9NYG2 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ZDHHC3Q9NYG2 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ZDHHC3Q9NYG2 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ZDHHC3Q9NYG2 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ZDHHC3Q9NYG2 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ZDHHC3Q9NYG2 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ZDHHC3Q9NYG2 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ZDHHC3Q9NYG2 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ZDHHC3Q9NYG2 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ZDHHC3Q9NYG2 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ZDHHC3Q9NYG2 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ZDHHC3Q9NYG2 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ZDHHC3Q9NYG2 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ZDHHC3Q9NYG2 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ZDHHC3Q9NYG2 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ZDHHC3Q9NYG2 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ZDHHC3Q9NYG2 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZDHHC3Q9NYG2 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZDHHC3Q9NYG2 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZDHHC3Q9NYG2 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZDHHC3Q9NYG2 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
ZDHHC3Q9NYG2 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZDHHC3Q9NYG2 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZDHHC3Q9NYG2 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZDHHC3Q9NYG2 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZDHHC3Q9NYG2 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZDHHC3Q9NYG2 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZDHHC3Q9NYG2 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZDHHC3Q9NYG2 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZDHHC3Q9NYG2 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZDHHC3Q9NYG2 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZDHHC3Q9NYG2 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
ZDHHC3Q9NYG2 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZDHHC3Q9NYG2 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZDHHC3Q9NYG2 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
ZDHHC3Q9NYG2 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZDHHC3Q9NYG2 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZDHHC3Q9NYG2 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZDHHC3Q9NYG2 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZDHHC3Q9NYG2 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZDHHC3Q9NYG2 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZDHHC3Q9NYG2 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
ZDHHC3Q9NYG2 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZDHHC3Q9NYG2 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZDHHC3Q9NYG2 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZDHHC3Q9NYG2 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZDHHC3Q9NYG2 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZDHHC3Q9NYG2 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZDHHC3Q9NYG2 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZDHHC3Q9NYG2 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZDHHC3Q9NYG2 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms