Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXP7

GIN1, Gypsy retrotransposon integrase-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIN1Q9NXP7 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GIN1Q9NXP7 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GIN1Q9NXP7 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
GIN1Q9NXP7 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GIN1Q9NXP7 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GIN1Q9NXP7 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GIN1Q9NXP7 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GIN1Q9NXP7 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GIN1Q9NXP7 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GIN1Q9NXP7 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GIN1Q9NXP7 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
GIN1Q9NXP7 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GIN1Q9NXP7 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GIN1Q9NXP7 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GIN1Q9NXP7 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
GIN1Q9NXP7 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
GIN1Q9NXP7 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
GIN1Q9NXP7 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
GIN1Q9NXP7 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GIN1Q9NXP7 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GIN1Q9NXP7 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GIN1Q9NXP7 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GIN1Q9NXP7 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GIN1Q9NXP7 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GIN1Q9NXP7 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GIN1Q9NXP7 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GIN1Q9NXP7 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GIN1Q9NXP7 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GIN1Q9NXP7 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GIN1Q9NXP7 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GIN1Q9NXP7 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GIN1Q9NXP7 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GIN1Q9NXP7 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GIN1Q9NXP7 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GIN1Q9NXP7 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GIN1Q9NXP7 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GIN1Q9NXP7 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GIN1Q9NXP7 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GIN1Q9NXP7 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GIN1Q9NXP7 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
GIN1Q9NXP7 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GIN1Q9NXP7 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GIN1Q9NXP7 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GIN1Q9NXP7 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GIN1Q9NXP7 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GIN1Q9NXP7 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GIN1Q9NXP7 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GIN1Q9NXP7 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
GIN1Q9NXP7 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GIN1Q9NXP7 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GIN1Q9NXP7 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GIN1Q9NXP7 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GIN1Q9NXP7 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GIN1Q9NXP7 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GIN1Q9NXP7 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GIN1Q9NXP7 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GIN1Q9NXP7 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GIN1Q9NXP7 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GIN1Q9NXP7 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GIN1Q9NXP7 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GIN1Q9NXP7 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GIN1Q9NXP7 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GIN1Q9NXP7 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GIN1Q9NXP7 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GIN1Q9NXP7 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GIN1Q9NXP7 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GIN1Q9NXP7 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GIN1Q9NXP7 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GIN1Q9NXP7 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GIN1Q9NXP7 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GIN1Q9NXP7 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GIN1Q9NXP7 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GIN1Q9NXP7 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GIN1Q9NXP7 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GIN1Q9NXP7 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
GIN1Q9NXP7 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GIN1Q9NXP7 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GIN1Q9NXP7 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GIN1Q9NXP7 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
GIN1Q9NXP7 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GIN1Q9NXP7 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GIN1Q9NXP7 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GIN1Q9NXP7 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GIN1Q9NXP7 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GIN1Q9NXP7 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GIN1Q9NXP7 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GIN1Q9NXP7 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GIN1Q9NXP7 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GIN1Q9NXP7 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GIN1Q9NXP7 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GIN1Q9NXP7 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GIN1Q9NXP7 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GIN1Q9NXP7 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GIN1Q9NXP7 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GIN1Q9NXP7 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GIN1Q9NXP7 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GIN1Q9NXP7 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GIN1Q9NXP7 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GIN1Q9NXP7 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GIN1Q9NXP7 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.9 ms