Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXJ5

PGPEP1, Pyroglutamyl-peptidase 1, humanhuman

Predictions only

Length 209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGPEP1Q9NXJ5 AC008543.3-201ENST00000586983 491 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PGPEP1Q9NXJ5 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PGPEP1Q9NXJ5 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PGPEP1Q9NXJ5 AC048344.4-201ENST00000619744 527 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
PGPEP1Q9NXJ5 AC087821.1-201ENST00000623639 567 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
PGPEP1Q9NXJ5 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PGPEP1Q9NXJ5 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PGPEP1Q9NXJ5 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PGPEP1Q9NXJ5 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PGPEP1Q9NXJ5 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PGPEP1Q9NXJ5 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PGPEP1Q9NXJ5 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PGPEP1Q9NXJ5 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PGPEP1Q9NXJ5 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PGPEP1Q9NXJ5 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PGPEP1Q9NXJ5 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PGPEP1Q9NXJ5 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PGPEP1Q9NXJ5 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PGPEP1Q9NXJ5 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PGPEP1Q9NXJ5 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
PGPEP1Q9NXJ5 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
PGPEP1Q9NXJ5 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PGPEP1Q9NXJ5 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PGPEP1Q9NXJ5 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PGPEP1Q9NXJ5 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PGPEP1Q9NXJ5 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PGPEP1Q9NXJ5 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PGPEP1Q9NXJ5 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PGPEP1Q9NXJ5 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PGPEP1Q9NXJ5 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PGPEP1Q9NXJ5 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
PGPEP1Q9NXJ5 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PGPEP1Q9NXJ5 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PGPEP1Q9NXJ5 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PGPEP1Q9NXJ5 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PGPEP1Q9NXJ5 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PGPEP1Q9NXJ5 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PGPEP1Q9NXJ5 SMIM11A-201ENST00000399292 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PGPEP1Q9NXJ5 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PGPEP1Q9NXJ5 LINC00571-201ENST00000434565 521 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PGPEP1Q9NXJ5 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PGPEP1Q9NXJ5 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PGPEP1Q9NXJ5 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PGPEP1Q9NXJ5 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PGPEP1Q9NXJ5 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PGPEP1Q9NXJ5 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PGPEP1Q9NXJ5 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PGPEP1Q9NXJ5 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PGPEP1Q9NXJ5 AC090950.1-202ENST00000605733 644 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
PGPEP1Q9NXJ5 AC021321.1-201ENST00000607397 1113 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
PGPEP1Q9NXJ5 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PGPEP1Q9NXJ5 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
PGPEP1Q9NXJ5 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PGPEP1Q9NXJ5 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PGPEP1Q9NXJ5 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PGPEP1Q9NXJ5 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PGPEP1Q9NXJ5 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PGPEP1Q9NXJ5 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PGPEP1Q9NXJ5 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PGPEP1Q9NXJ5 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PGPEP1Q9NXJ5 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PGPEP1Q9NXJ5 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PGPEP1Q9NXJ5 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PGPEP1Q9NXJ5 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PGPEP1Q9NXJ5 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PGPEP1Q9NXJ5 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PGPEP1Q9NXJ5 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PGPEP1Q9NXJ5 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PGPEP1Q9NXJ5 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PGPEP1Q9NXJ5 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PGPEP1Q9NXJ5 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PGPEP1Q9NXJ5 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PGPEP1Q9NXJ5 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PGPEP1Q9NXJ5 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PGPEP1Q9NXJ5 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PGPEP1Q9NXJ5 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PGPEP1Q9NXJ5 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PGPEP1Q9NXJ5 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PGPEP1Q9NXJ5 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
PGPEP1Q9NXJ5 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PGPEP1Q9NXJ5 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PGPEP1Q9NXJ5 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PGPEP1Q9NXJ5 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PGPEP1Q9NXJ5 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PGPEP1Q9NXJ5 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PGPEP1Q9NXJ5 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PGPEP1Q9NXJ5 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PGPEP1Q9NXJ5 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PGPEP1Q9NXJ5 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PGPEP1Q9NXJ5 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PGPEP1Q9NXJ5 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PGPEP1Q9NXJ5 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PGPEP1Q9NXJ5 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PGPEP1Q9NXJ5 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PGPEP1Q9NXJ5 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PGPEP1Q9NXJ5 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PGPEP1Q9NXJ5 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PGPEP1Q9NXJ5 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PGPEP1Q9NXJ5 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PGPEP1Q9NXJ5 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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