Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVC6

MED17, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 17, humanhuman

Predictions only

Length 651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED17Q9NVC6 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MED17Q9NVC6 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MED17Q9NVC6 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MED17Q9NVC6 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MED17Q9NVC6 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MED17Q9NVC6 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MED17Q9NVC6 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MED17Q9NVC6 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MED17Q9NVC6 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MED17Q9NVC6 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MED17Q9NVC6 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MED17Q9NVC6 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MED17Q9NVC6 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MED17Q9NVC6 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MED17Q9NVC6 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MED17Q9NVC6 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MED17Q9NVC6 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
MED17Q9NVC6 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
MED17Q9NVC6 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
MED17Q9NVC6 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
MED17Q9NVC6 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MED17Q9NVC6 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MED17Q9NVC6 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MED17Q9NVC6 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MED17Q9NVC6 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MED17Q9NVC6 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MED17Q9NVC6 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MED17Q9NVC6 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MED17Q9NVC6 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MED17Q9NVC6 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
MED17Q9NVC6 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MED17Q9NVC6 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MED17Q9NVC6 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MED17Q9NVC6 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MED17Q9NVC6 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MED17Q9NVC6 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MED17Q9NVC6 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MED17Q9NVC6 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
MED17Q9NVC6 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MED17Q9NVC6 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MED17Q9NVC6 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MED17Q9NVC6 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MED17Q9NVC6 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MED17Q9NVC6 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MED17Q9NVC6 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MED17Q9NVC6 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MED17Q9NVC6 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MED17Q9NVC6 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MED17Q9NVC6 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MED17Q9NVC6 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
MED17Q9NVC6 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MED17Q9NVC6 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
MED17Q9NVC6 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MED17Q9NVC6 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MED17Q9NVC6 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MED17Q9NVC6 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MED17Q9NVC6 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MED17Q9NVC6 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MED17Q9NVC6 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MED17Q9NVC6 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MED17Q9NVC6 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MED17Q9NVC6 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MED17Q9NVC6 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MED17Q9NVC6 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MED17Q9NVC6 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MED17Q9NVC6 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MED17Q9NVC6 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MED17Q9NVC6 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MED17Q9NVC6 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MED17Q9NVC6 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MED17Q9NVC6 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MED17Q9NVC6 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MED17Q9NVC6 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MED17Q9NVC6 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MED17Q9NVC6 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MED17Q9NVC6 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MED17Q9NVC6 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MED17Q9NVC6 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MED17Q9NVC6 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MED17Q9NVC6 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MED17Q9NVC6 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MED17Q9NVC6 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
MED17Q9NVC6 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MED17Q9NVC6 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MED17Q9NVC6 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MED17Q9NVC6 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MED17Q9NVC6 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
MED17Q9NVC6 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MED17Q9NVC6 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MED17Q9NVC6 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MED17Q9NVC6 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MED17Q9NVC6 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MED17Q9NVC6 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MED17Q9NVC6 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MED17Q9NVC6 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MED17Q9NVC6 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
MED17Q9NVC6 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MED17Q9NVC6 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MED17Q9NVC6 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MED17Q9NVC6 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms