Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT62

ATG3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG3Q9NT62 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATG3Q9NT62 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATG3Q9NT62 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATG3Q9NT62 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATG3Q9NT62 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATG3Q9NT62 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATG3Q9NT62 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATG3Q9NT62 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATG3Q9NT62 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATG3Q9NT62 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATG3Q9NT62 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATG3Q9NT62 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
ATG3Q9NT62 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
ATG3Q9NT62 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATG3Q9NT62 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATG3Q9NT62 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATG3Q9NT62 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATG3Q9NT62 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATG3Q9NT62 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATG3Q9NT62 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATG3Q9NT62 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATG3Q9NT62 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATG3Q9NT62 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATG3Q9NT62 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATG3Q9NT62 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
ATG3Q9NT62 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATG3Q9NT62 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATG3Q9NT62 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATG3Q9NT62 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATG3Q9NT62 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATG3Q9NT62 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATG3Q9NT62 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATG3Q9NT62 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATG3Q9NT62 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATG3Q9NT62 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATG3Q9NT62 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATG3Q9NT62 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATG3Q9NT62 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATG3Q9NT62 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATG3Q9NT62 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
ATG3Q9NT62 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATG3Q9NT62 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
ATG3Q9NT62 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATG3Q9NT62 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATG3Q9NT62 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATG3Q9NT62 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
ATG3Q9NT62 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATG3Q9NT62 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATG3Q9NT62 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATG3Q9NT62 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATG3Q9NT62 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
ATG3Q9NT62 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATG3Q9NT62 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATG3Q9NT62 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATG3Q9NT62 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATG3Q9NT62 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATG3Q9NT62 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATG3Q9NT62 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATG3Q9NT62 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
ATG3Q9NT62 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
ATG3Q9NT62 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATG3Q9NT62 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATG3Q9NT62 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATG3Q9NT62 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATG3Q9NT62 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
ATG3Q9NT62 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATG3Q9NT62 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
ATG3Q9NT62 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATG3Q9NT62 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATG3Q9NT62 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATG3Q9NT62 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATG3Q9NT62 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATG3Q9NT62 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATG3Q9NT62 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATG3Q9NT62 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATG3Q9NT62 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATG3Q9NT62 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
ATG3Q9NT62 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATG3Q9NT62 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATG3Q9NT62 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATG3Q9NT62 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATG3Q9NT62 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATG3Q9NT62 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATG3Q9NT62 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATG3Q9NT62 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATG3Q9NT62 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
ATG3Q9NT62 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
ATG3Q9NT62 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATG3Q9NT62 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
ATG3Q9NT62 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATG3Q9NT62 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATG3Q9NT62 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATG3Q9NT62 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATG3Q9NT62 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATG3Q9NT62 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATG3Q9NT62 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATG3Q9NT62 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATG3Q9NT62 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
ATG3Q9NT62 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATG3Q9NT62 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms