Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSI8

SAMSN1, SAM domain-containing protein SAMSN-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMSN1Q9NSI8 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SAMSN1Q9NSI8 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SAMSN1Q9NSI8 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
SAMSN1Q9NSI8 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SAMSN1Q9NSI8 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SAMSN1Q9NSI8 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SAMSN1Q9NSI8 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SAMSN1Q9NSI8 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SAMSN1Q9NSI8 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SAMSN1Q9NSI8 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SAMSN1Q9NSI8 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SAMSN1Q9NSI8 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
SAMSN1Q9NSI8 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SAMSN1Q9NSI8 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SAMSN1Q9NSI8 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SAMSN1Q9NSI8 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SAMSN1Q9NSI8 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SAMSN1Q9NSI8 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SAMSN1Q9NSI8 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SAMSN1Q9NSI8 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SAMSN1Q9NSI8 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SAMSN1Q9NSI8 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SAMSN1Q9NSI8 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SAMSN1Q9NSI8 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SAMSN1Q9NSI8 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SAMSN1Q9NSI8 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SAMSN1Q9NSI8 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SAMSN1Q9NSI8 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SAMSN1Q9NSI8 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SAMSN1Q9NSI8 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
SAMSN1Q9NSI8 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SAMSN1Q9NSI8 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SAMSN1Q9NSI8 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SAMSN1Q9NSI8 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
SAMSN1Q9NSI8 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SAMSN1Q9NSI8 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SAMSN1Q9NSI8 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SAMSN1Q9NSI8 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SAMSN1Q9NSI8 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SAMSN1Q9NSI8 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SAMSN1Q9NSI8 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SAMSN1Q9NSI8 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SAMSN1Q9NSI8 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SAMSN1Q9NSI8 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SAMSN1Q9NSI8 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SAMSN1Q9NSI8 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SAMSN1Q9NSI8 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SAMSN1Q9NSI8 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SAMSN1Q9NSI8 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SAMSN1Q9NSI8 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SAMSN1Q9NSI8 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SAMSN1Q9NSI8 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SAMSN1Q9NSI8 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SAMSN1Q9NSI8 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SAMSN1Q9NSI8 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SAMSN1Q9NSI8 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SAMSN1Q9NSI8 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
SAMSN1Q9NSI8 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
SAMSN1Q9NSI8 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SAMSN1Q9NSI8 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SAMSN1Q9NSI8 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SAMSN1Q9NSI8 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
SAMSN1Q9NSI8 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
SAMSN1Q9NSI8 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SAMSN1Q9NSI8 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
SAMSN1Q9NSI8 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
SAMSN1Q9NSI8 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SAMSN1Q9NSI8 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SAMSN1Q9NSI8 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SAMSN1Q9NSI8 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SAMSN1Q9NSI8 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SAMSN1Q9NSI8 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SAMSN1Q9NSI8 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SAMSN1Q9NSI8 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SAMSN1Q9NSI8 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SAMSN1Q9NSI8 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SAMSN1Q9NSI8 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SAMSN1Q9NSI8 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SAMSN1Q9NSI8 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SAMSN1Q9NSI8 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SAMSN1Q9NSI8 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SAMSN1Q9NSI8 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SAMSN1Q9NSI8 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SAMSN1Q9NSI8 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SAMSN1Q9NSI8 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SAMSN1Q9NSI8 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SAMSN1Q9NSI8 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SAMSN1Q9NSI8 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SAMSN1Q9NSI8 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SAMSN1Q9NSI8 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SAMSN1Q9NSI8 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SAMSN1Q9NSI8 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SAMSN1Q9NSI8 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SAMSN1Q9NSI8 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SAMSN1Q9NSI8 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SAMSN1Q9NSI8 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SAMSN1Q9NSI8 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SAMSN1Q9NSI8 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SAMSN1Q9NSI8 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SAMSN1Q9NSI8 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms