Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCM3

KIAA1549, UPF0606 protein KIAA1549, humanhuman

Predictions only

Length 1,950 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA1549Q9HCM3 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KIAA1549Q9HCM3 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KIAA1549Q9HCM3 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KIAA1549Q9HCM3 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KIAA1549Q9HCM3 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KIAA1549Q9HCM3 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KIAA1549Q9HCM3 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KIAA1549Q9HCM3 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KIAA1549Q9HCM3 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KIAA1549Q9HCM3 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KIAA1549Q9HCM3 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KIAA1549Q9HCM3 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KIAA1549Q9HCM3 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KIAA1549Q9HCM3 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KIAA1549Q9HCM3 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KIAA1549Q9HCM3 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KIAA1549Q9HCM3 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KIAA1549Q9HCM3 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KIAA1549Q9HCM3 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KIAA1549Q9HCM3 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
KIAA1549Q9HCM3 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KIAA1549Q9HCM3 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KIAA1549Q9HCM3 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KIAA1549Q9HCM3 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
KIAA1549Q9HCM3 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
KIAA1549Q9HCM3 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KIAA1549Q9HCM3 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KIAA1549Q9HCM3 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KIAA1549Q9HCM3 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KIAA1549Q9HCM3 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KIAA1549Q9HCM3 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KIAA1549Q9HCM3 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KIAA1549Q9HCM3 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KIAA1549Q9HCM3 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KIAA1549Q9HCM3 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KIAA1549Q9HCM3 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KIAA1549Q9HCM3 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KIAA1549Q9HCM3 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KIAA1549Q9HCM3 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KIAA1549Q9HCM3 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KIAA1549Q9HCM3 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KIAA1549Q9HCM3 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KIAA1549Q9HCM3 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KIAA1549Q9HCM3 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KIAA1549Q9HCM3 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KIAA1549Q9HCM3 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KIAA1549Q9HCM3 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
KIAA1549Q9HCM3 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KIAA1549Q9HCM3 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KIAA1549Q9HCM3 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
KIAA1549Q9HCM3 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
KIAA1549Q9HCM3 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KIAA1549Q9HCM3 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KIAA1549Q9HCM3 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KIAA1549Q9HCM3 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KIAA1549Q9HCM3 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KIAA1549Q9HCM3 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KIAA1549Q9HCM3 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KIAA1549Q9HCM3 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KIAA1549Q9HCM3 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KIAA1549Q9HCM3 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KIAA1549Q9HCM3 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KIAA1549Q9HCM3 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
KIAA1549Q9HCM3 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KIAA1549Q9HCM3 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KIAA1549Q9HCM3 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KIAA1549Q9HCM3 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KIAA1549Q9HCM3 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KIAA1549Q9HCM3 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KIAA1549Q9HCM3 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
KIAA1549Q9HCM3 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KIAA1549Q9HCM3 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KIAA1549Q9HCM3 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KIAA1549Q9HCM3 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KIAA1549Q9HCM3 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KIAA1549Q9HCM3 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KIAA1549Q9HCM3 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KIAA1549Q9HCM3 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KIAA1549Q9HCM3 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KIAA1549Q9HCM3 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KIAA1549Q9HCM3 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KIAA1549Q9HCM3 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KIAA1549Q9HCM3 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KIAA1549Q9HCM3 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KIAA1549Q9HCM3 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KIAA1549Q9HCM3 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KIAA1549Q9HCM3 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KIAA1549Q9HCM3 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KIAA1549Q9HCM3 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KIAA1549Q9HCM3 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KIAA1549Q9HCM3 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KIAA1549Q9HCM3 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KIAA1549Q9HCM3 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KIAA1549Q9HCM3 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KIAA1549Q9HCM3 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KIAA1549Q9HCM3 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KIAA1549Q9HCM3 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KIAA1549Q9HCM3 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KIAA1549Q9HCM3 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
KIAA1549Q9HCM3 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms