Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAU5

UPF2, Regulator of nonsense transcripts 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPF2Q9HAU5 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
UPF2Q9HAU5 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
UPF2Q9HAU5 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
UPF2Q9HAU5 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
UPF2Q9HAU5 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
UPF2Q9HAU5 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
UPF2Q9HAU5 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
UPF2Q9HAU5 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
UPF2Q9HAU5 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
UPF2Q9HAU5 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
UPF2Q9HAU5 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
UPF2Q9HAU5 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
UPF2Q9HAU5 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
UPF2Q9HAU5 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
UPF2Q9HAU5 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
UPF2Q9HAU5 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
UPF2Q9HAU5 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
UPF2Q9HAU5 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
UPF2Q9HAU5 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
UPF2Q9HAU5 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
UPF2Q9HAU5 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
UPF2Q9HAU5 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
UPF2Q9HAU5 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
UPF2Q9HAU5 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
UPF2Q9HAU5 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
UPF2Q9HAU5 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
UPF2Q9HAU5 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
UPF2Q9HAU5 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
UPF2Q9HAU5 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
UPF2Q9HAU5 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
UPF2Q9HAU5 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
UPF2Q9HAU5 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
UPF2Q9HAU5 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
UPF2Q9HAU5 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
UPF2Q9HAU5 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
UPF2Q9HAU5 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
UPF2Q9HAU5 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
UPF2Q9HAU5 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
UPF2Q9HAU5 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
UPF2Q9HAU5 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
UPF2Q9HAU5 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
UPF2Q9HAU5 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
UPF2Q9HAU5 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
UPF2Q9HAU5 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
UPF2Q9HAU5 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
UPF2Q9HAU5 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
UPF2Q9HAU5 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
UPF2Q9HAU5 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
UPF2Q9HAU5 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
UPF2Q9HAU5 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
UPF2Q9HAU5 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
UPF2Q9HAU5 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
UPF2Q9HAU5 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
UPF2Q9HAU5 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
UPF2Q9HAU5 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
UPF2Q9HAU5 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
UPF2Q9HAU5 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
UPF2Q9HAU5 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
UPF2Q9HAU5 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
UPF2Q9HAU5 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
UPF2Q9HAU5 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
UPF2Q9HAU5 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
UPF2Q9HAU5 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
UPF2Q9HAU5 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
UPF2Q9HAU5 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
UPF2Q9HAU5 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
UPF2Q9HAU5 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
UPF2Q9HAU5 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
UPF2Q9HAU5 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
UPF2Q9HAU5 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
UPF2Q9HAU5 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
UPF2Q9HAU5 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
UPF2Q9HAU5 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
UPF2Q9HAU5 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
UPF2Q9HAU5 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
UPF2Q9HAU5 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
UPF2Q9HAU5 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
UPF2Q9HAU5 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
UPF2Q9HAU5 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
UPF2Q9HAU5 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
UPF2Q9HAU5 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
UPF2Q9HAU5 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
UPF2Q9HAU5 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
UPF2Q9HAU5 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
UPF2Q9HAU5 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
UPF2Q9HAU5 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
UPF2Q9HAU5 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
UPF2Q9HAU5 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
UPF2Q9HAU5 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
UPF2Q9HAU5 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
UPF2Q9HAU5 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
UPF2Q9HAU5 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
UPF2Q9HAU5 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
UPF2Q9HAU5 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
UPF2Q9HAU5 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
UPF2Q9HAU5 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
UPF2Q9HAU5 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
UPF2Q9HAU5 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
UPF2Q9HAU5 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
UPF2Q9HAU5 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms