Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4D0

CLSTN2, Calsyntenin-2, humanhuman

Predictions only

Length 955 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN2Q9H4D0 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CLSTN2Q9H4D0 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLSTN2Q9H4D0 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLSTN2Q9H4D0 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLSTN2Q9H4D0 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLSTN2Q9H4D0 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLSTN2Q9H4D0 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLSTN2Q9H4D0 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CLSTN2Q9H4D0 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLSTN2Q9H4D0 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLSTN2Q9H4D0 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLSTN2Q9H4D0 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLSTN2Q9H4D0 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLSTN2Q9H4D0 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLSTN2Q9H4D0 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLSTN2Q9H4D0 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLSTN2Q9H4D0 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLSTN2Q9H4D0 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLSTN2Q9H4D0 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLSTN2Q9H4D0 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLSTN2Q9H4D0 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLSTN2Q9H4D0 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLSTN2Q9H4D0 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.87
CLSTN2Q9H4D0 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CLSTN2Q9H4D0 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CLSTN2Q9H4D0 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CLSTN2Q9H4D0 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CLSTN2Q9H4D0 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CLSTN2Q9H4D0 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CLSTN2Q9H4D0 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CLSTN2Q9H4D0 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CLSTN2Q9H4D0 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CLSTN2Q9H4D0 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CLSTN2Q9H4D0 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CLSTN2Q9H4D0 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CLSTN2Q9H4D0 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CLSTN2Q9H4D0 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CLSTN2Q9H4D0 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CLSTN2Q9H4D0 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CLSTN2Q9H4D0 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CLSTN2Q9H4D0 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CLSTN2Q9H4D0 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CLSTN2Q9H4D0 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CLSTN2Q9H4D0 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CLSTN2Q9H4D0 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CLSTN2Q9H4D0 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CLSTN2Q9H4D0 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CLSTN2Q9H4D0 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CLSTN2Q9H4D0 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CLSTN2Q9H4D0 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CLSTN2Q9H4D0 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CLSTN2Q9H4D0 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CLSTN2Q9H4D0 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CLSTN2Q9H4D0 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CLSTN2Q9H4D0 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CLSTN2Q9H4D0 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CLSTN2Q9H4D0 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CLSTN2Q9H4D0 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CLSTN2Q9H4D0 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CLSTN2Q9H4D0 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CLSTN2Q9H4D0 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CLSTN2Q9H4D0 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CLSTN2Q9H4D0 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CLSTN2Q9H4D0 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CLSTN2Q9H4D0 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CLSTN2Q9H4D0 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CLSTN2Q9H4D0 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CLSTN2Q9H4D0 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CLSTN2Q9H4D0 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CLSTN2Q9H4D0 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CLSTN2Q9H4D0 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CLSTN2Q9H4D0 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CLSTN2Q9H4D0 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CLSTN2Q9H4D0 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CLSTN2Q9H4D0 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CLSTN2Q9H4D0 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CLSTN2Q9H4D0 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CLSTN2Q9H4D0 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CLSTN2Q9H4D0 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CLSTN2Q9H4D0 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CLSTN2Q9H4D0 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CLSTN2Q9H4D0 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CLSTN2Q9H4D0 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CLSTN2Q9H4D0 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CLSTN2Q9H4D0 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CLSTN2Q9H4D0 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CLSTN2Q9H4D0 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CLSTN2Q9H4D0 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CLSTN2Q9H4D0 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CLSTN2Q9H4D0 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CLSTN2Q9H4D0 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CLSTN2Q9H4D0 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CLSTN2Q9H4D0 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CLSTN2Q9H4D0 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CLSTN2Q9H4D0 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CLSTN2Q9H4D0 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CLSTN2Q9H4D0 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CLSTN2Q9H4D0 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CLSTN2Q9H4D0 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CLSTN2Q9H4D0 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms