Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZL8

BPESC1, Putative BPES syndrome breakpoint region protein, humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPESC1Q9GZL8 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
BPESC1Q9GZL8 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
BPESC1Q9GZL8 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
BPESC1Q9GZL8 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
BPESC1Q9GZL8 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
BPESC1Q9GZL8 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
BPESC1Q9GZL8 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
BPESC1Q9GZL8 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
BPESC1Q9GZL8 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
BPESC1Q9GZL8 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
BPESC1Q9GZL8 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
BPESC1Q9GZL8 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC15.02■□□□□ -0
BPESC1Q9GZL8 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
BPESC1Q9GZL8 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC15.02■□□□□ -0
BPESC1Q9GZL8 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
BPESC1Q9GZL8 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
BPESC1Q9GZL8 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
BPESC1Q9GZL8 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
BPESC1Q9GZL8 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
BPESC1Q9GZL8 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
BPESC1Q9GZL8 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
BPESC1Q9GZL8 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
BPESC1Q9GZL8 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
BPESC1Q9GZL8 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
BPESC1Q9GZL8 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
BPESC1Q9GZL8 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
BPESC1Q9GZL8 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
BPESC1Q9GZL8 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
BPESC1Q9GZL8 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
BPESC1Q9GZL8 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
BPESC1Q9GZL8 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
BPESC1Q9GZL8 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
BPESC1Q9GZL8 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
BPESC1Q9GZL8 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
BPESC1Q9GZL8 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
BPESC1Q9GZL8 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
BPESC1Q9GZL8 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
BPESC1Q9GZL8 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
BPESC1Q9GZL8 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
BPESC1Q9GZL8 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
BPESC1Q9GZL8 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
BPESC1Q9GZL8 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
BPESC1Q9GZL8 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
BPESC1Q9GZL8 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
BPESC1Q9GZL8 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
BPESC1Q9GZL8 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
BPESC1Q9GZL8 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
BPESC1Q9GZL8 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
BPESC1Q9GZL8 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
BPESC1Q9GZL8 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
BPESC1Q9GZL8 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
BPESC1Q9GZL8 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
BPESC1Q9GZL8 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
BPESC1Q9GZL8 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
BPESC1Q9GZL8 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
BPESC1Q9GZL8 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
BPESC1Q9GZL8 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
BPESC1Q9GZL8 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
BPESC1Q9GZL8 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
BPESC1Q9GZL8 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
BPESC1Q9GZL8 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
BPESC1Q9GZL8 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
BPESC1Q9GZL8 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
BPESC1Q9GZL8 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
BPESC1Q9GZL8 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
BPESC1Q9GZL8 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
BPESC1Q9GZL8 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
BPESC1Q9GZL8 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
BPESC1Q9GZL8 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
BPESC1Q9GZL8 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
BPESC1Q9GZL8 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
BPESC1Q9GZL8 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
BPESC1Q9GZL8 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
BPESC1Q9GZL8 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
BPESC1Q9GZL8 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
BPESC1Q9GZL8 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
BPESC1Q9GZL8 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
BPESC1Q9GZL8 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
BPESC1Q9GZL8 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
BPESC1Q9GZL8 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
BPESC1Q9GZL8 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
BPESC1Q9GZL8 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC15□□□□□ -0.01
BPESC1Q9GZL8 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
BPESC1Q9GZL8 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
BPESC1Q9GZL8 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
BPESC1Q9GZL8 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
BPESC1Q9GZL8 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
BPESC1Q9GZL8 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
BPESC1Q9GZL8 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
BPESC1Q9GZL8 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
BPESC1Q9GZL8 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
BPESC1Q9GZL8 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
BPESC1Q9GZL8 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
BPESC1Q9GZL8 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
BPESC1Q9GZL8 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
BPESC1Q9GZL8 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
BPESC1Q9GZL8 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
BPESC1Q9GZL8 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
BPESC1Q9GZL8 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
BPESC1Q9GZL8 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms