Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0J9

BHLHE41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE41Q9C0J9 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BHLHE41Q9C0J9 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
BHLHE41Q9C0J9 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BHLHE41Q9C0J9 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BHLHE41Q9C0J9 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BHLHE41Q9C0J9 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BHLHE41Q9C0J9 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BHLHE41Q9C0J9 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BHLHE41Q9C0J9 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BHLHE41Q9C0J9 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BHLHE41Q9C0J9 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BHLHE41Q9C0J9 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BHLHE41Q9C0J9 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BHLHE41Q9C0J9 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BHLHE41Q9C0J9 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
BHLHE41Q9C0J9 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BHLHE41Q9C0J9 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
BHLHE41Q9C0J9 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BHLHE41Q9C0J9 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BHLHE41Q9C0J9 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BHLHE41Q9C0J9 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BHLHE41Q9C0J9 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
BHLHE41Q9C0J9 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BHLHE41Q9C0J9 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BHLHE41Q9C0J9 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BHLHE41Q9C0J9 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BHLHE41Q9C0J9 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BHLHE41Q9C0J9 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BHLHE41Q9C0J9 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BHLHE41Q9C0J9 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BHLHE41Q9C0J9 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BHLHE41Q9C0J9 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BHLHE41Q9C0J9 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BHLHE41Q9C0J9 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BHLHE41Q9C0J9 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BHLHE41Q9C0J9 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BHLHE41Q9C0J9 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BHLHE41Q9C0J9 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BHLHE41Q9C0J9 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BHLHE41Q9C0J9 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BHLHE41Q9C0J9 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BHLHE41Q9C0J9 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BHLHE41Q9C0J9 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BHLHE41Q9C0J9 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BHLHE41Q9C0J9 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BHLHE41Q9C0J9 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BHLHE41Q9C0J9 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BHLHE41Q9C0J9 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BHLHE41Q9C0J9 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BHLHE41Q9C0J9 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
BHLHE41Q9C0J9 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BHLHE41Q9C0J9 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BHLHE41Q9C0J9 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BHLHE41Q9C0J9 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BHLHE41Q9C0J9 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BHLHE41Q9C0J9 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BHLHE41Q9C0J9 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
BHLHE41Q9C0J9 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
BHLHE41Q9C0J9 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BHLHE41Q9C0J9 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BHLHE41Q9C0J9 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BHLHE41Q9C0J9 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BHLHE41Q9C0J9 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BHLHE41Q9C0J9 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BHLHE41Q9C0J9 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BHLHE41Q9C0J9 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BHLHE41Q9C0J9 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BHLHE41Q9C0J9 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BHLHE41Q9C0J9 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BHLHE41Q9C0J9 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BHLHE41Q9C0J9 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BHLHE41Q9C0J9 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BHLHE41Q9C0J9 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BHLHE41Q9C0J9 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BHLHE41Q9C0J9 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BHLHE41Q9C0J9 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BHLHE41Q9C0J9 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BHLHE41Q9C0J9 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BHLHE41Q9C0J9 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BHLHE41Q9C0J9 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BHLHE41Q9C0J9 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BHLHE41Q9C0J9 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BHLHE41Q9C0J9 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BHLHE41Q9C0J9 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BHLHE41Q9C0J9 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
BHLHE41Q9C0J9 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BHLHE41Q9C0J9 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BHLHE41Q9C0J9 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
BHLHE41Q9C0J9 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BHLHE41Q9C0J9 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BHLHE41Q9C0J9 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BHLHE41Q9C0J9 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BHLHE41Q9C0J9 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BHLHE41Q9C0J9 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BHLHE41Q9C0J9 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BHLHE41Q9C0J9 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BHLHE41Q9C0J9 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BHLHE41Q9C0J9 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BHLHE41Q9C0J9 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BHLHE41Q9C0J9 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms