Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C4

SEMA4C, Semaphorin-4C, humanhuman

Predictions only

Length 833 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4CQ9C0C4 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SEMA4CQ9C0C4 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SEMA4CQ9C0C4 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SEMA4CQ9C0C4 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SEMA4CQ9C0C4 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SEMA4CQ9C0C4 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SEMA4CQ9C0C4 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SEMA4CQ9C0C4 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SEMA4CQ9C0C4 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SEMA4CQ9C0C4 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SEMA4CQ9C0C4 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SEMA4CQ9C0C4 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SEMA4CQ9C0C4 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SEMA4CQ9C0C4 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SEMA4CQ9C0C4 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SEMA4CQ9C0C4 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SEMA4CQ9C0C4 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SEMA4CQ9C0C4 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
SEMA4CQ9C0C4 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
SEMA4CQ9C0C4 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
SEMA4CQ9C0C4 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SEMA4CQ9C0C4 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
SEMA4CQ9C0C4 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SEMA4CQ9C0C4 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SEMA4CQ9C0C4 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SEMA4CQ9C0C4 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SEMA4CQ9C0C4 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SEMA4CQ9C0C4 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SEMA4CQ9C0C4 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SEMA4CQ9C0C4 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SEMA4CQ9C0C4 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SEMA4CQ9C0C4 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SEMA4CQ9C0C4 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SEMA4CQ9C0C4 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SEMA4CQ9C0C4 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SEMA4CQ9C0C4 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SEMA4CQ9C0C4 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SEMA4CQ9C0C4 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SEMA4CQ9C0C4 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SEMA4CQ9C0C4 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SEMA4CQ9C0C4 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SEMA4CQ9C0C4 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SEMA4CQ9C0C4 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SEMA4CQ9C0C4 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SEMA4CQ9C0C4 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SEMA4CQ9C0C4 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SEMA4CQ9C0C4 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SEMA4CQ9C0C4 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SEMA4CQ9C0C4 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SEMA4CQ9C0C4 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SEMA4CQ9C0C4 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SEMA4CQ9C0C4 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SEMA4CQ9C0C4 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SEMA4CQ9C0C4 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SEMA4CQ9C0C4 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SEMA4CQ9C0C4 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEMA4CQ9C0C4 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEMA4CQ9C0C4 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEMA4CQ9C0C4 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEMA4CQ9C0C4 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEMA4CQ9C0C4 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEMA4CQ9C0C4 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEMA4CQ9C0C4 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEMA4CQ9C0C4 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEMA4CQ9C0C4 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEMA4CQ9C0C4 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEMA4CQ9C0C4 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEMA4CQ9C0C4 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEMA4CQ9C0C4 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEMA4CQ9C0C4 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEMA4CQ9C0C4 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SEMA4CQ9C0C4 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEMA4CQ9C0C4 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEMA4CQ9C0C4 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEMA4CQ9C0C4 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEMA4CQ9C0C4 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEMA4CQ9C0C4 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEMA4CQ9C0C4 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SEMA4CQ9C0C4 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEMA4CQ9C0C4 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEMA4CQ9C0C4 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEMA4CQ9C0C4 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEMA4CQ9C0C4 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEMA4CQ9C0C4 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEMA4CQ9C0C4 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEMA4CQ9C0C4 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEMA4CQ9C0C4 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEMA4CQ9C0C4 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEMA4CQ9C0C4 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEMA4CQ9C0C4 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SEMA4CQ9C0C4 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEMA4CQ9C0C4 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEMA4CQ9C0C4 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEMA4CQ9C0C4 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEMA4CQ9C0C4 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEMA4CQ9C0C4 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEMA4CQ9C0C4 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEMA4CQ9C0C4 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEMA4CQ9C0C4 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEMA4CQ9C0C4 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms