Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYR8

KRTAP3-1, Keratin-associated protein 3-1, humanhuman

Predictions only

Length 98 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP3-1Q9BYR8 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC9.2□□□□□ -0.94
KRTAP3-1Q9BYR8 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC9.2□□□□□ -0.94
KRTAP3-1Q9BYR8 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC9.2□□□□□ -0.94
KRTAP3-1Q9BYR8 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
KRTAP3-1Q9BYR8 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
KRTAP3-1Q9BYR8 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
KRTAP3-1Q9BYR8 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
KRTAP3-1Q9BYR8 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
KRTAP3-1Q9BYR8 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
KRTAP3-1Q9BYR8 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC9.2□□□□□ -0.94
KRTAP3-1Q9BYR8 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
KRTAP3-1Q9BYR8 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
KRTAP3-1Q9BYR8 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
KRTAP3-1Q9BYR8 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
KRTAP3-1Q9BYR8 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
KRTAP3-1Q9BYR8 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
KRTAP3-1Q9BYR8 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
KRTAP3-1Q9BYR8 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
KRTAP3-1Q9BYR8 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC9.2□□□□□ -0.94
KRTAP3-1Q9BYR8 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC9.2□□□□□ -0.94
KRTAP3-1Q9BYR8 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC9.2□□□□□ -0.94
KRTAP3-1Q9BYR8 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
KRTAP3-1Q9BYR8 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
KRTAP3-1Q9BYR8 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC9.2□□□□□ -0.94
KRTAP3-1Q9BYR8 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
KRTAP3-1Q9BYR8 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC9.2□□□□□ -0.94
KRTAP3-1Q9BYR8 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
KRTAP3-1Q9BYR8 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
KRTAP3-1Q9BYR8 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
KRTAP3-1Q9BYR8 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
KRTAP3-1Q9BYR8 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP3-1Q9BYR8 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP3-1Q9BYR8 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP3-1Q9BYR8 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP3-1Q9BYR8 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP3-1Q9BYR8 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP3-1Q9BYR8 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP3-1Q9BYR8 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP3-1Q9BYR8 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP3-1Q9BYR8 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP3-1Q9BYR8 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP3-1Q9BYR8 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP3-1Q9BYR8 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP3-1Q9BYR8 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP3-1Q9BYR8 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP3-1Q9BYR8 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP3-1Q9BYR8 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP3-1Q9BYR8 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP3-1Q9BYR8 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP3-1Q9BYR8 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP3-1Q9BYR8 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP3-1Q9BYR8 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP3-1Q9BYR8 AL109935.1-201ENST00000413249 473 ntTSL 3 BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP3-1Q9BYR8 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP3-1Q9BYR8 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP3-1Q9BYR8 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP3-1Q9BYR8 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP3-1Q9BYR8 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP3-1Q9BYR8 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP3-1Q9BYR8 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP3-1Q9BYR8 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP3-1Q9BYR8 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP3-1Q9BYR8 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP3-1Q9BYR8 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP3-1Q9BYR8 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP3-1Q9BYR8 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP3-1Q9BYR8 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP3-1Q9BYR8 LINC01837-201ENST00000590021 1320 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP3-1Q9BYR8 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP3-1Q9BYR8 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP3-1Q9BYR8 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP3-1Q9BYR8 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP3-1Q9BYR8 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP3-1Q9BYR8 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP3-1Q9BYR8 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP3-1Q9BYR8 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP3-1Q9BYR8 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP3-1Q9BYR8 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP3-1Q9BYR8 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP3-1Q9BYR8 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP3-1Q9BYR8 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP3-1Q9BYR8 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP3-1Q9BYR8 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP3-1Q9BYR8 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP3-1Q9BYR8 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP3-1Q9BYR8 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
KRTAP3-1Q9BYR8 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
KRTAP3-1Q9BYR8 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
KRTAP3-1Q9BYR8 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
KRTAP3-1Q9BYR8 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
KRTAP3-1Q9BYR8 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
KRTAP3-1Q9BYR8 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
KRTAP3-1Q9BYR8 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
KRTAP3-1Q9BYR8 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
KRTAP3-1Q9BYR8 MYL10-201ENST00000223167 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
KRTAP3-1Q9BYR8 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
KRTAP3-1Q9BYR8 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.18□□□□□ -0.94
KRTAP3-1Q9BYR8 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
KRTAP3-1Q9BYR8 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC9.18□□□□□ -0.94
KRTAP3-1Q9BYR8 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms