Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYM8

RBCK1, RanBP-type and C3HC4-type zinc finger-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 510 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBCK1Q9BYM8 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
RBCK1Q9BYM8 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RBCK1Q9BYM8 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RBCK1Q9BYM8 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RBCK1Q9BYM8 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RBCK1Q9BYM8 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RBCK1Q9BYM8 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RBCK1Q9BYM8 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RBCK1Q9BYM8 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RBCK1Q9BYM8 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
RBCK1Q9BYM8 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RBCK1Q9BYM8 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RBCK1Q9BYM8 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RBCK1Q9BYM8 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RBCK1Q9BYM8 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RBCK1Q9BYM8 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RBCK1Q9BYM8 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RBCK1Q9BYM8 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RBCK1Q9BYM8 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RBCK1Q9BYM8 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RBCK1Q9BYM8 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RBCK1Q9BYM8 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RBCK1Q9BYM8 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RBCK1Q9BYM8 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RBCK1Q9BYM8 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RBCK1Q9BYM8 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RBCK1Q9BYM8 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RBCK1Q9BYM8 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RBCK1Q9BYM8 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RBCK1Q9BYM8 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RBCK1Q9BYM8 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RBCK1Q9BYM8 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RBCK1Q9BYM8 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RBCK1Q9BYM8 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RBCK1Q9BYM8 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RBCK1Q9BYM8 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RBCK1Q9BYM8 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RBCK1Q9BYM8 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RBCK1Q9BYM8 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RBCK1Q9BYM8 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RBCK1Q9BYM8 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RBCK1Q9BYM8 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RBCK1Q9BYM8 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
RBCK1Q9BYM8 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RBCK1Q9BYM8 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RBCK1Q9BYM8 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RBCK1Q9BYM8 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RBCK1Q9BYM8 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RBCK1Q9BYM8 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RBCK1Q9BYM8 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RBCK1Q9BYM8 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RBCK1Q9BYM8 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RBCK1Q9BYM8 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RBCK1Q9BYM8 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RBCK1Q9BYM8 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RBCK1Q9BYM8 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RBCK1Q9BYM8 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RBCK1Q9BYM8 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RBCK1Q9BYM8 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RBCK1Q9BYM8 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
RBCK1Q9BYM8 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RBCK1Q9BYM8 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RBCK1Q9BYM8 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RBCK1Q9BYM8 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RBCK1Q9BYM8 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RBCK1Q9BYM8 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RBCK1Q9BYM8 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RBCK1Q9BYM8 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RBCK1Q9BYM8 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RBCK1Q9BYM8 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RBCK1Q9BYM8 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RBCK1Q9BYM8 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
RBCK1Q9BYM8 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RBCK1Q9BYM8 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RBCK1Q9BYM8 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RBCK1Q9BYM8 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RBCK1Q9BYM8 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RBCK1Q9BYM8 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RBCK1Q9BYM8 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RBCK1Q9BYM8 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RBCK1Q9BYM8 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RBCK1Q9BYM8 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RBCK1Q9BYM8 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RBCK1Q9BYM8 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RBCK1Q9BYM8 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RBCK1Q9BYM8 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RBCK1Q9BYM8 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RBCK1Q9BYM8 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
RBCK1Q9BYM8 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RBCK1Q9BYM8 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RBCK1Q9BYM8 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RBCK1Q9BYM8 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RBCK1Q9BYM8 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RBCK1Q9BYM8 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RBCK1Q9BYM8 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RBCK1Q9BYM8 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RBCK1Q9BYM8 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RBCK1Q9BYM8 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RBCK1Q9BYM8 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RBCK1Q9BYM8 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms