Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYE7

PCGF6, Polycomb group RING finger protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF6Q9BYE7 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PCGF6Q9BYE7 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PCGF6Q9BYE7 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PCGF6Q9BYE7 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PCGF6Q9BYE7 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PCGF6Q9BYE7 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PCGF6Q9BYE7 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PCGF6Q9BYE7 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
PCGF6Q9BYE7 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PCGF6Q9BYE7 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PCGF6Q9BYE7 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PCGF6Q9BYE7 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PCGF6Q9BYE7 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PCGF6Q9BYE7 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PCGF6Q9BYE7 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PCGF6Q9BYE7 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PCGF6Q9BYE7 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PCGF6Q9BYE7 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PCGF6Q9BYE7 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PCGF6Q9BYE7 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PCGF6Q9BYE7 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PCGF6Q9BYE7 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PCGF6Q9BYE7 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PCGF6Q9BYE7 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PCGF6Q9BYE7 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PCGF6Q9BYE7 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PCGF6Q9BYE7 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PCGF6Q9BYE7 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PCGF6Q9BYE7 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PCGF6Q9BYE7 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PCGF6Q9BYE7 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PCGF6Q9BYE7 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PCGF6Q9BYE7 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PCGF6Q9BYE7 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PCGF6Q9BYE7 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PCGF6Q9BYE7 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PCGF6Q9BYE7 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PCGF6Q9BYE7 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PCGF6Q9BYE7 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
PCGF6Q9BYE7 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
PCGF6Q9BYE7 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PCGF6Q9BYE7 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PCGF6Q9BYE7 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PCGF6Q9BYE7 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PCGF6Q9BYE7 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PCGF6Q9BYE7 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PCGF6Q9BYE7 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PCGF6Q9BYE7 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PCGF6Q9BYE7 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PCGF6Q9BYE7 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PCGF6Q9BYE7 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PCGF6Q9BYE7 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PCGF6Q9BYE7 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PCGF6Q9BYE7 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PCGF6Q9BYE7 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PCGF6Q9BYE7 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PCGF6Q9BYE7 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PCGF6Q9BYE7 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
PCGF6Q9BYE7 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PCGF6Q9BYE7 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PCGF6Q9BYE7 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PCGF6Q9BYE7 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PCGF6Q9BYE7 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PCGF6Q9BYE7 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PCGF6Q9BYE7 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PCGF6Q9BYE7 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PCGF6Q9BYE7 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
PCGF6Q9BYE7 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PCGF6Q9BYE7 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PCGF6Q9BYE7 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PCGF6Q9BYE7 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PCGF6Q9BYE7 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PCGF6Q9BYE7 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PCGF6Q9BYE7 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
PCGF6Q9BYE7 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PCGF6Q9BYE7 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PCGF6Q9BYE7 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PCGF6Q9BYE7 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PCGF6Q9BYE7 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PCGF6Q9BYE7 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PCGF6Q9BYE7 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PCGF6Q9BYE7 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PCGF6Q9BYE7 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PCGF6Q9BYE7 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PCGF6Q9BYE7 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PCGF6Q9BYE7 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PCGF6Q9BYE7 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PCGF6Q9BYE7 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PCGF6Q9BYE7 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PCGF6Q9BYE7 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
PCGF6Q9BYE7 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PCGF6Q9BYE7 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PCGF6Q9BYE7 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
PCGF6Q9BYE7 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PCGF6Q9BYE7 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PCGF6Q9BYE7 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PCGF6Q9BYE7 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
PCGF6Q9BYE7 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PCGF6Q9BYE7 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PCGF6Q9BYE7 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms