Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY60

GABARAPL3, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPL3Q9BY60 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GABARAPL3Q9BY60 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GABARAPL3Q9BY60 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GABARAPL3Q9BY60 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GABARAPL3Q9BY60 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GABARAPL3Q9BY60 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
GABARAPL3Q9BY60 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GABARAPL3Q9BY60 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GABARAPL3Q9BY60 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GABARAPL3Q9BY60 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GABARAPL3Q9BY60 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
GABARAPL3Q9BY60 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GABARAPL3Q9BY60 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
GABARAPL3Q9BY60 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
GABARAPL3Q9BY60 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GABARAPL3Q9BY60 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GABARAPL3Q9BY60 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GABARAPL3Q9BY60 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GABARAPL3Q9BY60 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GABARAPL3Q9BY60 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
GABARAPL3Q9BY60 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GABARAPL3Q9BY60 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GABARAPL3Q9BY60 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GABARAPL3Q9BY60 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GABARAPL3Q9BY60 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GABARAPL3Q9BY60 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GABARAPL3Q9BY60 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GABARAPL3Q9BY60 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GABARAPL3Q9BY60 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GABARAPL3Q9BY60 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GABARAPL3Q9BY60 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GABARAPL3Q9BY60 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GABARAPL3Q9BY60 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GABARAPL3Q9BY60 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GABARAPL3Q9BY60 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GABARAPL3Q9BY60 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GABARAPL3Q9BY60 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GABARAPL3Q9BY60 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GABARAPL3Q9BY60 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GABARAPL3Q9BY60 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GABARAPL3Q9BY60 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GABARAPL3Q9BY60 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GABARAPL3Q9BY60 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GABARAPL3Q9BY60 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
GABARAPL3Q9BY60 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
GABARAPL3Q9BY60 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GABARAPL3Q9BY60 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GABARAPL3Q9BY60 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GABARAPL3Q9BY60 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GABARAPL3Q9BY60 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GABARAPL3Q9BY60 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GABARAPL3Q9BY60 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
GABARAPL3Q9BY60 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GABARAPL3Q9BY60 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GABARAPL3Q9BY60 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GABARAPL3Q9BY60 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GABARAPL3Q9BY60 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GABARAPL3Q9BY60 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABARAPL3Q9BY60 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABARAPL3Q9BY60 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABARAPL3Q9BY60 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABARAPL3Q9BY60 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABARAPL3Q9BY60 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABARAPL3Q9BY60 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABARAPL3Q9BY60 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABARAPL3Q9BY60 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABARAPL3Q9BY60 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABARAPL3Q9BY60 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABARAPL3Q9BY60 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABARAPL3Q9BY60 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABARAPL3Q9BY60 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABARAPL3Q9BY60 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABARAPL3Q9BY60 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABARAPL3Q9BY60 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABARAPL3Q9BY60 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABARAPL3Q9BY60 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABARAPL3Q9BY60 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABARAPL3Q9BY60 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABARAPL3Q9BY60 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABARAPL3Q9BY60 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
GABARAPL3Q9BY60 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABARAPL3Q9BY60 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABARAPL3Q9BY60 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABARAPL3Q9BY60 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABARAPL3Q9BY60 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABARAPL3Q9BY60 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABARAPL3Q9BY60 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABARAPL3Q9BY60 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABARAPL3Q9BY60 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABARAPL3Q9BY60 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GABARAPL3Q9BY60 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GABARAPL3Q9BY60 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GABARAPL3Q9BY60 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GABARAPL3Q9BY60 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GABARAPL3Q9BY60 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
GABARAPL3Q9BY60 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GABARAPL3Q9BY60 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GABARAPL3Q9BY60 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GABARAPL3Q9BY60 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GABARAPL3Q9BY60 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms